RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341472.9

SYNE2-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNE2, Length 1,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE2-201ENST00000341472 PPEF2O14830 753 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 TYMPP19971 482 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 CASP5P51878 434 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 ADCY1Q08828 1119 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 HTR4Q13639 388 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 E2F4Q16254 413 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 SENP8Q96LD8 212 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 FAM213AQ9BRX8 229 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 TMEM206Q9H813 350 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 WNT16Q9UBV4 365 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 CFAP45Q9UL16 551 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 PIEZO1Q92508 2521 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 ANO9A1A5B4 782 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 OR6C75A6NL08 312 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 IL18RAPO95256 599 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 RHOP08100 348 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 SRFP11831 508 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 CPB1P15086 417 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 GARTP22102 1010 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 ME1P48163 572 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 CLCN5P51795 746 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 NUBP1P53384 320 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 PTPN5P54829 565 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 NHLH1Q02575 133 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 PRSS33Q8NF86 280 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 FLCNQ8NFG4 579 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 DPP3Q9NY33 737 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE2-201ENST00000341472 SPTLC1O15269 473 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 CFHP08603 1231 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 PARM1Q6UWI2 310 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 MTSS1LQ765P7 747 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 SIX5Q8N196 739 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 CORO1BQ9BR76 489 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 TRIM9Q9C026 710 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 PLXNA3P51805 1871 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 ODC1P11926 461 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 PKP1Q13835 747 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 MYBPC2Q14324 1141 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 IQCEQ6IPM2 695 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 ELMOD1Q8N336 334 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 SAAL1Q96ER3 474 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 MCRS1Q96EZ8 462 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 STK25O00506 426 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 ZNF197O14709 1029 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 EXTL3O43909 919 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 OR4Q2P0C623 313 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 NPR3P17342 541 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 ASIC1P78348 528 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 GPR17Q13304 367 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 METTL23Q86XA0 190 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 ING5Q8WYH8 240 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 FGF14Q92915 247 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 HPS3Q969F9 1004 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 PCIF1Q9H4Z3 704 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 GDE1Q9NZC3 331 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 DSEQ9UL01 958 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 CYB561D2O14569 222 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 TAF6P49848 677 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 TWF1Q12792 350 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 TCF15Q12870 199 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 DUSP4Q13115 394 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 CNNM4Q6P4Q7 775 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 CBWD1Q9BRT8 395 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE2-201ENST00000341472 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms