RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 STOML1Q9UBI4 398 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 C5orf58C9J3I9 102 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 IL10P22301 178 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 RAD23BP54727 409 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D19Q8N5T2 526 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 NT5C1AQ9BXI3 368 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 RASA1P20936 1047 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 BRD2P25440 801 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2H1P32780 548 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 ADSSL1Q8N142 457 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 KLK14Q9P0G3 267 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 STILQ15468 1287 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 ENTPD3O75355 529 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 SLC9A1P19634 815 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 RFC5P40937 340 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 APOL5Q9BWW9 433 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 NEU2Q9Y3R4 380 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 STK4Q13043 487 aa23.45■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 SBK1Q52WX2 424 aa23.45■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.45■■□□□ 1.35
PTPRM-201ENST00000332175 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
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PTPRM-201ENST00000332175 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 PSMD3O43242 534 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 IL18RAPO95256 599 aa23.45■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 GJB7Q6PEY0 223 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 ANO5Q75V66 913 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.45■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 C10orf120Q5SQS8 335 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.45■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 WWP1Q9H0M0 922 aa23.45■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 SGO1Q5FBB7 561 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 ADNPQ9H2P0 1102 aa23.45■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 C11orf96Q7Z7L8 435 aa23.44■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 SLC38A7Q9NVC3 462 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 UVRAGQ9P2Y5 699 aa23.44■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 PGM1P36871 562 aa23.44■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 HUNKP57058 714 aa23.44■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 MEI1Q5TIA1 1274 aa23.44■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 YY1AP1Q9H869 796 aa23.44■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 SPATA21Q7Z572 469 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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PTPRM-201ENST00000332175 EXTL3O43909 919 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 GPD1P21695 349 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRM-201ENST00000332175 TSPAN17Q96FV3 270 aa23.43■■□□□ 1.34
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