RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322175.7

TPRX1-201, Transcript of tetrapeptide repeat homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPRX1, Length 1,924 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRX1-201ENST00000322175 RABGGTAQ92696 567 aa16.72■□□□□ 0.27
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TPRX1-201ENST00000322175 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TPRX1-201ENST00000322175 RPS6KC1Q96S38 1066 aa16.72■□□□□ 0.27
TPRX1-201ENST00000322175 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.72■□□□□ 0.27
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TPRX1-201ENST00000322175 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
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TPRX1-201ENST00000322175 EPC2Q52LR7 807 aa16.71■□□□□ 0.27
TPRX1-201ENST00000322175 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
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TPRX1-201ENST00000322175 ZNF697Q5TEC3 545 aa16.7■□□□□ 0.26
TPRX1-201ENST00000322175 EHBP1Q8NDI1 1231 aa16.7■□□□□ 0.26
TPRX1-201ENST00000322175 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.7■□□□□ 0.26
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TPRX1-201ENST00000322175 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.69■□□□□ 0.26
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TPRX1-201ENST00000322175 PRDM12Q9H4Q4 367 aa16.69■□□□□ 0.26
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TPRX1-201ENST00000322175 MYO9BQ13459 2157 aa16.69■□□□□ 0.26
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TPRX1-201ENST00000322175 LDHAP00338 332 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
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TPRX1-201ENST00000322175 UQCRHP07919 91 aa16.68■□□□□ 0.26
TPRX1-201ENST00000322175 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TPRX1-201ENST00000322175 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
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TPRX1-201ENST00000322175 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TPRX1-201ENST00000322175 CYP24A1Q07973 514 aa16.68■□□□□ 0.26
TPRX1-201ENST00000322175 GRIK3Q13003 919 aa16.68■□□□□ 0.26
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