RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-202ENST00000319107 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-202ENST00000319107 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-202ENST00000319107 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-202ENST00000319107 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-202ENST00000319107 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-202ENST00000319107 STK39Q9UEW8 545 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-202ENST00000319107 MUC6Q6W4X9 2439 aa21.77■■□□□ 1.08
RALGPS1-202ENST00000319107 TADA2AO75478 443 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 PNPLA4P41247 253 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 BIRC3Q13489 604 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 NCAPHQ15003 741 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 SV2AQ7L0J3 742 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.76■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 PI4K2BG5E9Z4 385 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 GRM6O15303 877 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 CAVIN2O95810 425 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 KRT19P08727 400 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 PAX3P23760 479 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 BRCC3P46736 316 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 GCLMP48507 274 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 TAF6P49848 677 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 MXI1P50539 228 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF445P59923 1031 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 RBP5P82980 135 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 POF1BQ8WVV4 589 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 C11orf16Q9NQ32 467 aa21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 PHACTR2O75167 634 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 VNN1O95497 513 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 SOD2P04179 222 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 IQCB1Q15051 598 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 SV2CQ496J9 727 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 KRT39Q6A163 491 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 SUSD3Q96L08 255 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 ZBP1Q9H171 429 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 TSPY26PQ9H489 355 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 TLR9Q9NR96 1032 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 FANCLQ9NW38 375 aa21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 SMTNL1A8MU46 457 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 KCNJ18B7U540 433 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 SPTLC1O15269 473 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 TRAPPC3O43617 180 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 DNAJB1P25685 340 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 PIK3CAP42336 1068 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 LILRA4P59901 499 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 TRPC3Q13507 836 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 KCNJ12Q14500 433 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 CBWD6Q4V339 395 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 VPS52Q8N1B4 723 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 CBX8Q9HC52 389 aa21.73■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 I3L4J1 428 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 M0QZQ0 153 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 NCK2O43639 380 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 HLA-DRAP01903 254 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 ATICP31939 592 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 FMO5P49326 533 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 MYL7Q01449 175 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 MYO1EQ12965 1108 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 NCOA4Q13772 614 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 CAMK1Q14012 370 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 MAN2A1Q16706 1144 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.72■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM86C2PA6NEL3 165 aa21.71■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 PRR33A8MZF0 331 aa21.71■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 KPNA7A9QM74 516 aa21.71■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 FSCN2O14926 492 aa21.71■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 SYN3O14994 580 aa21.71■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 CTSAP10619 480 aa21.71■■□□□ 1.07
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF18P17022 549 aa21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms