RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313843.7

STX4-201, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STX4, Length 1,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-201ENST00000313843 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.55■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23.55■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 LRRC52Q8N7C0 313 aa23.55■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 C3orf58Q8NDZ4 430 aa23.55■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 TAF4BQ92750 862 aa23.55■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 ZNF560Q96MR9 790 aa23.55■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 RAD9AQ99638 391 aa23.55■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 ARID3AQ99856 593 aa23.55■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 TLL1O43897 1013 aa23.54■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 MYO1EQ12965 1108 aa23.54■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.54■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.54■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 CHRDL2Q6WN34 429 aa23.54■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.54■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 KREMEN1Q96MU8 473 aa23.54■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 UROC1Q96N76 676 aa23.54■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 VRTNQ9H8Y1 702 aa23.54■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.54■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 F8W810 466 aa23.53■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 SPTLC1O15269 473 aa23.53■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 STAU1O95793 577 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 RPL9P32969 192 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 TAF6P49848 677 aa23.53■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 WDR72Q3MJ13 1102 aa23.53■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 TDHQ8IZJ6 230 aa23.53■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 BAP1Q92560 729 aa23.53■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.53■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 FBXL5Q9UKA1 691 aa23.53■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 CAPN11Q9UMQ6 739 aa23.53■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 VWA8A3KMH1 1905 aa23.53■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 A0A1W2PQJ5 194 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 MFAP3LO75121 409 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 TPM1P09493 284 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 PNPLA4P41247 253 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 ASPAP45381 313 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 RAP1GAPP47736 663 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 OR1G1P47890 313 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 CUL2Q13617 745 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 SV2CQ496J9 727 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 HASPINQ8TF76 798 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 IQCDQ96DY2 449 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-201ENST00000313843 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 KIF4AO95239 1232 aa23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 RFX1P22670 979 aa23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 TNNC1P63316 161 aa23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 GCNT1Q02742 428 aa23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 ARID5BQ14865 1188 aa23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 CWH43Q9H720 699 aa23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 SNX9Q9Y5X1 595 aa23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 LRRC53A6NM62 1247 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 ITGB1P05556 798 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 PBX3P40426 434 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 RABGGTBP53611 331 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 MFAP3P55082 362 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 JAM2P57087 298 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 LILRA4P59901 499 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 PDXDC1Q6P996 788 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 CD300LGQ6UXG3 332 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 FIBCD1Q8N539 461 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 TC2NQ8N9U0 490 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 SPAG5Q96R06 1193 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 EDEM3Q9BZQ6 932 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 GPR88Q9GZN0 384 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 SDCBP2Q9H190 292 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 KPNA7A9QM74 516 aa23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 B3GAT3O94766 335 aa23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 KRT9P35527 623 aa23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 SLC11A1P49279 550 aa23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 ZBED6P86452 979 aa23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 BCO2Q9BYV7 579 aa23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 F8VZ95 297 aa23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 NRP1O14786 923 aa23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 WEE2P0C1S8 567 aa23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 BRCC3P46736 316 aa23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 CNGA4Q8IV77 575 aa23.49■■□□□ 1.35
STX4-201ENST00000313843 MMS19Q96T76 1030 aa23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms