RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 POLIQ9UNA4 740 aa23.75■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 BAIAP3O94812 1187 aa23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 AMHP03971 560 aa23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 RPL9P32969 192 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 TAF6P49848 677 aa23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 CLCNKBP51801 687 aa23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 ARID5AQ03989 594 aa23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 SHC3Q92529 594 aa23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 CASD1Q96PB1 797 aa23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 CACNG4Q9UBN1 327 aa23.74■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 USP8P40818 1118 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 ASPAP45381 313 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 GATMP50440 423 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 TNNC1P63316 161 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 CCZ1BP86790 482 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 ASIC2Q16515 512 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 MEA1Q16626 185 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 TMEM139Q8IV31 216 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 PODXLO00592 558 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 GFPT2O94808 682 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 DDHD2O94830 711 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 FGBP02675 491 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 SKILP12757 684 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 FECHP22830 423 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 SV2CQ496J9 727 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 ZNF365Q70YC5 407 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 TOP1MTQ969P6 601 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 UROC1Q96N76 676 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 CHP1Q99653 195 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 SNX9Q9Y5X1 595 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 PTPRSQ13332 1948 aa23.73■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 KPNA7A9QM74 516 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 WEE2P0C1S8 567 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 FERP16591 822 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 LILRA4P59901 499 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 UPP1Q16831 310 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 FAM71AQ8IYT1 594 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 MMS19Q96T76 1030 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 BCO2Q9BYV7 579 aa23.72■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.71■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 SPTLC1O15269 473 aa23.71■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 CCDC172P0C7W6 258 aa23.71■■□□□ 1.39
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CTU2-201ENST00000312060 KCNJ6P48051 423 aa23.71■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 DEFB103AP81534 67 aa23.71■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 CDK17Q00537 523 aa23.71■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 DSC1Q08554 894 aa23.71■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 TNS4Q8IZW8 715 aa23.71■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 RABGGTAQ92696 567 aa23.71■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.71■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa23.71■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 DGKIO75912 1065 aa23.7■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 SERPING1P05155 500 aa23.7■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 KRT5P13647 590 aa23.7■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 CDH8P55286 799 aa23.7■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.7■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 HGSNATQ68CP4 663 aa23.7■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 CISHQ9NSE2 258 aa23.7■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 GDAP2Q9NXN4 497 aa23.7■■□□□ 1.39
CTU2-201ENST00000312060 ZBBXA8MT70 800 aa23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 B3GAT3O94766 335 aa23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 CD58P19256 250 aa23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 RAP1GAPP47736 663 aa23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 EPHB4P54760 987 aa23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 TMEM270Q6UE05 265 aa23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 UBR7Q8N806 425 aa23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa23.7■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 SOWAHDA6NJG2 315 aa23.69■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 CYP26A1O43174 497 aa23.69■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 PRKCIP41743 596 aa23.69■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 TMEM240Q5SV17 173 aa23.69■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 SDCBP2Q9H190 292 aa23.69■■□□□ 1.38
CTU2-201ENST00000312060 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.69■■□□□ 1.38
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