RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.8□□□□□ -0.84
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PDE4D-201ENST00000309641 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.8□□□□□ -0.84
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PDE4D-201ENST00000309641 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.78□□□□□ -0.84
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PDE4D-201ENST00000309641 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-201ENST00000309641 TLE6Q9H808 572 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-201ENST00000309641 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-201ENST00000309641 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-201ENST00000309641 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-201ENST00000309641 NME7Q9Y5B8 376 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-201ENST00000309641 TSC2P49815 1807 aa9.77□□□□□ -0.84
PDE4D-201ENST00000309641 TBC1D4O60343 1298 aa9.77□□□□□ -0.85
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