RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM42Q8IWZ5 723 aa15.54■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C11orf63Q6NUN7 778 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 POTEJP0CG39 1038 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-201ENST00000300213 BASP1P80723 227 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
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