RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ANO4Q32M45 955 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 WDR93Q6P2C0 686 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 LZICQ8WZA0 190 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 WEE2P0C1S8 567 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 BARGINQ6ZT62 677 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.142e-6■□□□□ 9.8
CCSAP-201ENST00000284617 CMTM5Q96DZ9 223 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA18Q8TC71 538 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 AGAP3Q96P47 875 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 RUBCNLQ9H714 662 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 AURKCQ9UQB9 309 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 RGS7P49802 495 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 GRIN1Q05586 938 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 DTX3LQ8TDB6 740 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 EXTL3O43909 919 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 RBP3P10745 1247 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CPB1P15086 417 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PRLRP16471 622 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 USP10Q14694 798 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf89Q6UX73 402 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINB12Q96P63 405 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 COG4Q9H9E3 785 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CASS4Q9NQ75 786 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 DDX5P17844 614 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PTK2BQ14289 1009 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 FIGNQ5HY92 759 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CSPG5O95196 566 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SLC29A2Q14542 456 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf20Q8ND61 904 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 DLC1Q96QB1 1528 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC3O43617 180 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CST8O60676 142 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ACADSBP45954 432 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PDK1Q15118 436 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PRKCEQ02156 737 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 VEPH1Q14D04 833 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRN2Q92932 1015 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 NAGPAQ9UK23 515 aa22.15■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 TSPOAP1O95153 1857 aa22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SEC24CP53992 1094 aa22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K10Q02779 954 aa22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 RDM1Q8NG50 284 aa22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 NTSR2O95665 410 aa22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ1P48048 391 aa22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SCFD2Q8WU76 684 aa22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 KRT16P08779 473 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 EFHBQ8N7U6 833 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 CD4P01730 458 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 POLBP06746 335 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 HSD17B3P37058 310 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.14■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM66O15016 1216 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC6O75061 913 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 FAM151AQ8WW52 585 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 VPS33BQ9H267 617 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 AFF2P51816 1311 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 LVRNQ6Q4G3 990 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 TEX9Q8N6V9 391 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 CALML6Q8TD86 181 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 HPSEQ9Y251 543 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms