RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKCIP41743 596 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 FNTAP49354 379 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 SPDYCQ5MJ68 293 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 AGBL2Q5U5Z8 902 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 MAATS1Q7Z4T9 603 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 GPBP1Q86WP2 473 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 SYCE1Q8N0S2 351 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 CCT8L2Q96SF2 557 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 SQORQ9Y6N5 450 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM9Q13443 819 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP85LQ5SZL2 805 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF410Q86VK4 478 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS36Q86VN1 386 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ESYT3A0FGR9 886 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 GFPT2O94808 682 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTN1P12814 892 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 GLIS3Q8NEA6 775 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 USP20Q9Y2K6 914 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK3O14649 394 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 GUCY1A3Q02108 690 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNH2Q12809 1159 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPN7Q9Y6W3 813 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRIQ4A6NIV6 560 aa28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 H0YHG0 523 aa28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ENPP3O14638 875 aa28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ASAP2O43150 1006 aa28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 RABGGTBP53611 331 aa28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 PTENP60484 403 aa28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM117BQ6P1L5 589 aa28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD17Q8N5Z5 321 aa28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC57Q8N9N7 239 aa28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 SCFD1Q8WVM8 642 aa28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 MYH11P35749 1972 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 PBX2P40425 430 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 RASGEF1CQ8N431 466 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC26Q8TAB7 109 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 LRCH3Q96II8 777 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 REEP2Q9BRK0 252 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 BAIAP3O94812 1187 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD17B3P37058 310 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP2R5EQ16537 467 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 SLFN11Q7Z7L1 901 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 APBB2Q92870 758 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 SPAG5Q96R06 1193 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 GBF1Q92538 1859 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR182O15218 404 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 AFPP02771 609 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 MYOGP15173 224 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 PEX3P56589 373 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC42EP1Q00587 391 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 CLUL1Q15846 466 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 P3H4Q92791 437 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM2Q99965 735 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 NCAPGQ9BPX3 1015 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 NFS1Q9Y697 457 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC3P53804 2025 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPC1 479 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 TTLL13PA6NNM8 815 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 UPP2O95045 317 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ECHS1P30084 290 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 CDR1P51861 262 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 PTK2Q05397 1052 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 GIT2Q14161 759 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 TAX1BP1Q86VP1 789 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL7Q8IXQ5 586 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC14L1Q92503 715 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 NAGPAQ9UK23 515 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 EDN1P05305 212 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 PAEPP09466 180 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 MBTD1Q05BQ5 628 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 FMNL3Q8IVF7 1028 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 KIFAP3Q92845 792 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 PACSIN1Q9BY11 444 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 RABEP2Q9H5N1 569 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM114A2Q9NRY5 505 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-201ENST00000246533 NENFQ9UMX5 172 aa28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms