RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 SYN3O14994 580 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 KRT19P08727 400 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIM49P0CI25 452 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIM49CP0CI26 452 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 DUSP6Q16828 381 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF560Q96MR9 790 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 VCANP13611 3396 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 KRT13P13646 458 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 PNPLA4P41247 253 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 AP3M2P53677 418 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 RBP5P82980 135 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 USP37Q86T82 979 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 SENP8Q96LD8 212 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 TEX28O15482 410 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 CST3P01034 146 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 RPL17P18621 184 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 PAX3P23760 479 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 PSMD5Q16401 504 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 SV2CQ496J9 727 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 PCDHB8Q9UN66 801 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 KPNA7A9QM74 516 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP3CAQ08209 521 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNC3Q14003 757 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 ZACNQ401N2 412 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 DSTYKQ6XUX3 929 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 SV2AQ7L0J3 742 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 KLHL5Q96PQ7 755 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 IGFLR1Q9H665 355 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 FNIP2Q9P278 1114 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 DACH1Q9UI36 760 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 LINC01565O15544 149 aa23.42■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 GLP2RO95838 553 aa23.42■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 BIRC3Q13489 604 aa23.42■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 PDXDC1Q6P996 788 aa23.42■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.42■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.42■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 EFHBQ8N7U6 833 aa23.42■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 HPDLQ96IR7 371 aa23.42■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 CLSTN3Q9BQT9 956 aa23.42■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 MTRRQ9UBK8 725 aa23.42■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 VNN1O95497 513 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 ODC1P11926 461 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 GCLMP48507 274 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 FRMD5Q7Z6J6 570 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 APPL2Q8NEU8 664 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 XYLT2Q9H1B5 865 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 GDAP2Q9NXN4 497 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 ADH1AP07327 375 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 CREMQ03060 361 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 MYO1EQ12965 1108 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 STX1AQ16623 288 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC35C1Q96A29 364 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 FSD2A1L4K1 749 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 CYB561D2O14569 222 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 ADAM12O43184 909 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 NCK2O43639 380 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 TBC1D4O60343 1298 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 OAZ2O95190 189 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP11A1P05108 521 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 TYMPP19971 482 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 KLRC2P26717 231 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 NDUFV1P49821 464 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 CLCN4P51793 760 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 MARSP56192 900 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 MYL6P60660 151 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 ADAM15Q13444 863 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 NCOA4Q13772 614 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-201ENST00000225308 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms