RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 F5H5T6 163 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 STX7O15400 261 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 IMPDH2P12268 514 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 SLC1A1P43005 524 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 DMC1Q14565 340 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 DEFB132Q7Z7B7 95 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 OXER1Q8TDS5 423 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 TRIM17Q9Y577 477 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 SYNMO15061 1565 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 ERVK-7P63135 1459 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CLASP1Q7Z460 1538 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 GSG1L2A8MUP6 293 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 PDXKO00764 312 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 KPNA6O60684 536 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CHRM3P20309 590 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 SCP2P22307 547 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 PRCPP42785 496 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 FRMD5Q7Z6J6 570 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CNPY4Q8N129 248 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 FBXO32Q969P5 355 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CIPCQ9C0C6 399 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 MROH8Q9H579 483 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CPA4Q9UI42 421 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 SCOCQ9UIL1 159 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 MSRAQ9UJ68 235 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CTXN3Q4LDR2 81 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 SMIM5Q71RC9 77 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 ITIH5Q86UX2 942 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 SNF8Q96H20 258 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF556Q9HAH1 456 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 SPASTQ9UBP0 616 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 KRT4P19013 534 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 PKP1Q13835 747 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 PDK1Q15118 436 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF284Q2VY69 593 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC78A2IDD5 438 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 MYL4P12829 197 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 ARSEP51690 589 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 IZUMO3Q5VZ72 239 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 AGPAT1Q99943 283 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 KRT8P05787 483 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 IL10P22301 178 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 USP10Q14694 798 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 NECTIN1Q15223 517 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 EMBQ6PCB8 327 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 RCOR2Q8IZ40 523 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC3Q9BQI4 270 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 KCND2Q9NZV8 630 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 TSPOAP1O95153 1857 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 TADA3O75528 432 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CKBP12277 381 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 HPGDP15428 266 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 DNAJB2P25686 324 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 GUCY1A2P33402 732 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 GRK3P35626 688 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 RFX3P48380 749 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 TRPC1P48995 793 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 PDIA6Q15084 440 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CATSPER3Q86XQ3 398 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 IPMKQ8NFU5 416 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 AGR3Q8TD06 166 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 DDI1Q8WTU0 396 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 PNKPQ96T60 521 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 SENP2Q9HC62 589 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 MAP2K2P36507 400 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 PDIA5Q14554 519 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 KLK14Q9P0G3 267 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 DISP1Q96F81 1524 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 TBX3O15119 743 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 RTN2O75298 545 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 PCDH8O95206 1070 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-201ENST00000220888 AMHP03971 560 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms