RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039559.8

Thbs1-201, Transcript of Thrombospondin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Thbs1, Length 5,848 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3173A6NAS3 172 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3020E9Q3J7 150 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm2897K7N6T7 172 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyp2d11P24457 504 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 H2afxP27661 143 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dab1P97318 588 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lrig3Q6P1C6 1117 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Znf579Q80VM4 562 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ece2Q80Z60 881 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3411Q8C7R2 150 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 TwnkQ8CIW5 685 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdk17Q8K0D0 523 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pcdha9Q91Y11 979 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Emc2Q9CRD2 297 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Iqgap3F8VQ29 1632 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rasa2P58069 847 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Eps15l1Q60902 907 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trpc1Q61056 793 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Atg9bQ6EBV9 922 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem59lQ7TNI2 337 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Wnk4Q80UE6 1222 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc44a2Q8BY89 706 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mill1Q8HWE7 395 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Snrnp27Q8K194 155 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 BfarQ8R079 450 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Stk33Q924X7 491 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trim12aQ99PQ1 284 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lsp1P19973 330 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdc25cP48967 447 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Epas1P97481 874 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 RubcnlQ3TD16 648 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gpt2Q8BGT5 522 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Q8BP99 230 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 HpdlQ8K248 371 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Thg1lQ9CY52 298 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 LrmdaQ9D9B4 229 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gabbr1Q9WV18 960 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ppef2O35385 757 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PolgP54099 1218 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rad54lP70270 747 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Meis3P97368 378 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem109Q3UBX0 243 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Klra7Q60654 280 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam185aQ7TPD2 378 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Syne4Q8CII8 388 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dnajc28Q8VCE1 385 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Extl2Q9ES89 330 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zfyve9A2A8R0 1397 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hecw2Q6I6G8 1578 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tlx1P43345 332 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Faf2Q3TDN2 445 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pdp2Q504M2 532 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Papd7Q6PB75 542 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam107aQ78TU8 144 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn2r43Q80Z08 845 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 RbakQ8BQC8 711 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Psmd12Q9D8W5 456 aa9.75□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm29554A0A087WNW4 188 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Acnat1A2AKK5 416 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Etnk2A7MCT6 385 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem132bF7BAB2 1078 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Usp35M0QWN7 1009 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Alkbh1P0CB42 389 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CnpP16330 420 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc16a1P53986 493 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Q3UJP5 209 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ankrd42Q3V096 527 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Znf496Q5SXI5 585 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tcf12Q61286 706 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Chi3l1Q61362 389 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam120bQ6RI63 786 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ssxb10Q6XAR7 170 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rnf139Q7TMV1 668 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pdk1Q8BFP9 434 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 GanQ8CA72 597 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr395Q8VGR3 312 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Agap3Q8VHH5 910 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pcdha10Q91Y20 946 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Got1P05201 413 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tbc1d12Q6A039 696 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ano5Q75UR0 904 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam118bQ8C569 351 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gid8Q9D7M1 228 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Arhgap33Q80YF9 1305 aa9.74□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm1141B9EJU1 475 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22 ms