RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD62A6NC57 917 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 NGEFQ8N5V2 710 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 OLFM4Q6UX06 510 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC66A2RUB6 948 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM161AQ3B820 660 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-207ENST00000613246 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 GGT6Q6P531 493 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 EVA1CP58658 441 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 REC8O95072 547 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF20Q5VTR2 975 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 FOXD1Q16676 465 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 ERLIN2O94905 339 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 SYCP1Q15431 976 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRJ-207ENST00000613246 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 KIAA0754O94854 1291 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 FYB1O15117 783 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 SMARCE1Q969G3 411 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 INCENPQ9NQS7 918 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 NUTM2FA1L443 756 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 PDE4AP27815 886 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 CENPHQ9H3R5 247 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PTPRJ-207ENST00000613246 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 SMC2O95347 1197 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 NECTIN2Q92692 538 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 ERCC6Q03468 1493 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 MTMR7Q9Y216 660 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 KDM4AO75164 1064 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 XBP1P17861 261 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 SDF4Q9BRK5 362 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 PLIN1O60240 522 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC27Q2M243 656 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 PKD2Q13563 968 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 TAX1BP1Q86VP1 789 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 EZRP15311 586 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM5Q9C035 493 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 NUCB2P80303 420 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRJ-207ENST00000613246 EID1Q9Y6B2 187 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 NF2P35240 595 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 TEFQ10587 303 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 KLHL34Q8N239 644 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF27Q86VH2 1401 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.31■■□□□ 1.16
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