RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608473.5

GTF3C2-AS1-211, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 554 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DSG3P32926 999 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IDI1Q13907 227 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.27□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LRRC7Q96NW7 1537 aa13.27□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLIT1O75093 1534 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KCNA6P17658 529 aa13.23□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.23□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SYNMO15061 1565 aa13.23□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.23□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.22□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.22□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PIK3C2BO00750 1634 aa13.21□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ADGRL2O95490 1459 aa13.2□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NOS1P29475 1434 aa13.19□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMEM94Q12767 1356 aa13.19□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FKBP8Q14318 412 aa13.18□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP13.18□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ITGAEP38570 1179 aa13.17□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.17□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C14orf37Q86TY3 774 aa13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MSH6P52701 1360 aa13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.15□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ADGRB3O60242 1522 aa13.15□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ALKQ9UM73 1620 aa13.15□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.13□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.13□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NUP155O75694 1391 aa13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ROCK1Q13464 1354 aa13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLAIN2Q9P270 581 aa13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TBX22Q9Y458 520 aa13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TET3O43151 1660 aa13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZFYVE9O95405 1425 aa13.08□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ATF3P18847 181 aa13.08□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CADPS2Q86UW7 1296 aa13.07□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C19orf44Q9H6X5 657 aa13.06□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UNC13BO14795 1591 aa13.06□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.05□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PIK3R4Q99570 1358 aa13.05□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.05□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NWD1Q149M9 1564 aa13.04□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa13.04□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.04□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 JCADQ9P266 1359 aa13.04□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa13.03□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.01□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 E9PCH4 1651 aa13□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DIP2AQ14689 1571 aa13□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRIM52Q96A61 297 aa13□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRPM2O94759 1503 aa12.99□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa12.99□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 POTEAQ6S8J7 498 aa12.99□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MYO5BQ9ULV0 1848 aa12.98□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PHLPP1O60346 1717 aa12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 VGFO15240 615 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BRINP3Q76B58 766 aa12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PTPRUQ92729 1446 aa12.93□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DCCP43146 1447 aa12.92□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 METP08581 1390 aa12.91□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa12.9□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa12.9□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa12.9□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NAIPQ13075 1403 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RXRBP28702 533 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MST1RQ04912 1400 aa12.87□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms