RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STAC3Q96MF2 364 aa15.74■□□□□ 0.11
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa15.73■□□□□ 0.11
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDCA8Q53HL2 280 aa15.72■□□□□ 0.11
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.08
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF521Q96K83 1311 aa15.55■□□□□ 0.08
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa15.5■□□□□ 0.07
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADGRB1O14514 1584 aa15.5■□□□□ 0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPLO60437 1756 aa15.5■□□□□ 0.07
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEUROD2Q15784 382 aa15.49■□□□□ 0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CABP2Q9NPB3 220 aa15.49■□□□□ 0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEO1Q92859 1461 aa15.49■□□□□ 0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.47■□□□□ 0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa15.47■□□□□ 0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15.47■□□□□ 0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCAR3O75815 825 aa15.47■□□□□ 0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.46■□□□□ 0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTHFSP49914 203 aa15.45■□□□□ 0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 QRICH2Q9H0J4 1663 aa15.45■□□□□ 0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDE4AP27815 886 aa15.44■□□□□ 0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
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