RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 MBD5Q9P267 1494 aa9.15□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 DAPK1P53355 1430 aa9.14□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 CROCC2H7BZ55 1655 aa9.14□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 AFAP1Q8N556 730 aa9.14□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 RAPGEF3O95398 923 aa9.13□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.13□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.13□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.12□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP74Q9C0B2 1584 aa9.12□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGEF5Q12774 1597 aa9.12□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.11□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 NEO1Q92859 1461 aa9.11□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 KDM6BO15054 1643 aa9.11□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.1□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf84Q5VXU9 1444 aa9.1□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 RICTORQ6R327 1708 aa9.1□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.1□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa9.09□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 POGZQ7Z3K3 1410 aa9.09□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.09□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.08□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.08□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.07□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP7AQ04656 1500 aa9.07□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHL34Q8N239 644 aa9.07□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 KDM5CP41229 1560 aa9.07□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 MAST1Q9Y2H9 1570 aa9.07□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCA6Q8N139 1617 aa9.06□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPY4P0CV99 314 aa9.06□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPY10P0CW01 314 aa9.06□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.06□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.06□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.06□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 NAIPQ13075 1403 aa9.05□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.05□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa9.05□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 NCOA1Q15788 1441 aa9.05□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.04□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRL2O95490 1459 aa9.04□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.04□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF15Q9NS87 1388 aa9.04□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.04□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.04□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.03□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 PLXNC1O60486 1568 aa9.03□□□□□ -0.96
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.02□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 CABP2Q9NPB3 220 aa9.02□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 HFM1A2PYH4 1435 aa9.02□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.02□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 ROCK1Q13464 1354 aa9.01□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.01□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 A2MP01023 1474 aa9□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM52Q96A61 297 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 MLECQ14165 292 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF3BO15066 747 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR153Q6NV75 609 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP10AO60312 1499 aa8.96□□□□□ -0.97
CAPNS1-208ENST00000589162 MROH1Q8NDA8 1641 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 FKBP8Q14318 412 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 UNC13BO14795 1591 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP152O94986 1710 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 GGT6Q6P531 493 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 HCSTQ9UBK5 93 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 ERBINQ96RT1 1412 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 PZPP20742 1482 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 PBX2P40425 430 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 NUP155O75694 1391 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 DEPDC5O75140 1603 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 IQGAP3Q86VI3 1631 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 REREQ9P2R6 1566 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 MPHOSPH9Q99550 1183 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-208ENST00000589162 AGLP35573 1532 aa8.9□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.9□□□□□ -0.99
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
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