RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC7Q96M83 1385 aa31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-207ENST00000589146 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-207ENST00000589146 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
CAPNS1-207ENST00000589146 MIER1Q8N108 512 aa31.91■■■□□ 2.7
CAPNS1-207ENST00000589146 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-207ENST00000589146 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFYVE9O95405 1425 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-207ENST00000589146 IQGAP1P46940 1657 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-207ENST00000589146 PIK3C2GO75747 1445 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-207ENST00000589146 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-207ENST00000589146 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-207ENST00000589146 VGFO15240 615 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-207ENST00000589146 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-207ENST00000589146 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-207ENST00000589146 CFAP70Q5T0N1 1121 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-207ENST00000589146 TNRQ92752 1358 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-207ENST00000589146 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-207ENST00000589146 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-207ENST00000589146 TESK2Q96S53 571 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGRB1O14514 1584 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-207ENST00000589146 C3P01024 1663 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-207ENST00000589146 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRP1Q9C000 1473 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-207ENST00000589146 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-207ENST00000589146 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-207ENST00000589146 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-207ENST00000589146 ANP32CO43423 234 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC24A1O60721 1099 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-207ENST00000589146 TMF1P82094 1093 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-207ENST00000589146 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-207ENST00000589146 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-207ENST00000589146 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-207ENST00000589146 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-207ENST00000589146 ALKQ9UM73 1620 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-207ENST00000589146 CCER2I3L3R5 266 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-207ENST00000589146 HDGFP51858 240 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-207ENST00000589146 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-207ENST00000589146 CDCA8Q53HL2 280 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM132EQ6IEE7 984 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-207ENST00000589146 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-207ENST00000589146 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-207ENST00000589146 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-207ENST00000589146 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAK1Q9UPV9 953 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-207ENST00000589146 SLIT1O75093 1534 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPRMP28827 1452 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-207ENST00000589146 QRICH2Q9H0J4 1663 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-207ENST00000589146 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-207ENST00000589146 DLC1Q96QB1 1528 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-207ENST00000589146 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-207ENST00000589146 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-207ENST00000589146 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCC11Q96J66 1382 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-207ENST00000589146 MYOM1P52179 1685 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-207ENST00000589146 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-207ENST00000589146 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-207ENST00000589146 LTKP29376 864 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa31.26■■■□□ 2.6
CAPNS1-207ENST00000589146 EID1Q9Y6B2 187 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-207ENST00000589146 MED14O60244 1454 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-207ENST00000589146 KNDC1Q76NI1 1749 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-207ENST00000589146 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PANK3Q9H999 370 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SIRT1Q96EB6 747 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-207ENST00000589146 STK26Q9P289 416 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-207ENST00000589146 METP08581 1390 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-207ENST00000589146 TECPR2O15040 1411 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-207ENST00000589146 TULP4Q9NRJ4 1543 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-207ENST00000589146 EVC2Q86UK5 1308 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-207ENST00000589146 PRAM1Q96QH2 718 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-207ENST00000589146 DIP2AQ14689 1571 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM135BQ49AJ0 1406 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-207ENST00000589146 RALBP1Q15311 655 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CPS1P31327 1500 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-207ENST00000589146 POGKQ9P215 609 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-207ENST00000589146 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-207ENST00000589146 TBX22Q9Y458 520 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-207ENST00000589146 PARD3Q8TEW0 1356 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-207ENST00000589146 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms