RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 PLCH2O75038 1416 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 PREX2Q70Z35 1606 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 CFAP44Q96MT7 982 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 HCSTQ9UBK5 93 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 ATP10AO60312 1499 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 CERKQ8TCT0 537 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 REREQ9P2R6 1566 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 EEA1Q15075 1411 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 ABCC1P33527 1531 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 ILDR2Q71H61 639 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 GOLGA2Q08379 1002 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-206ENST00000578093 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 MROH2AA6NES4 1674 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 LCE2BO14633 110 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 FMN1Q68DA7 1419 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 AGLP35573 1532 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 Q6ZNB5 142 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 AFAP1Q8N556 730 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 CABP2Q9NPB3 220 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 PLXNC1O60486 1568 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 PTPRTO14522 1441 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 NCOA1Q15788 1441 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 CLIP1P30622 1438 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 SOX12O15370 315 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 SOCS7O14512 581 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 NLRP6P59044 892 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 ATP7AQ04656 1500 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-206ENST00000578093 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 NPATQ14207 1427 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 MFRPQ9BY79 579 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 TIAM1Q13009 1591 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 PLA2R1Q13018 1463 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 PTPRKQ15262 1439 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 ALKQ9UM73 1620 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 A2MP01023 1474 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 PHF8Q9UPP1 1060 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 ZMYM3Q14202 1370 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 STRCP1A6NGW2 1772 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-206ENST00000578093 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-206ENST00000578093 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-206ENST00000578093 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
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