RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557522.1

FRMD6-218, Transcript of FERM domain containing 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FRMD6, Length 5,123 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6-218ENST00000557522 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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FRMD6-218ENST00000557522 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD6-218ENST00000557522 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.62□□□□□ -0.07
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FRMD6-218ENST00000557522 CBX1P83916 185 aa14.62□□□□□ -0.07
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FRMD6-218ENST00000557522 ROCK1Q13464 1354 aa14.62□□□□□ -0.07
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FRMD6-218ENST00000557522 CCDC192P0DO97 292 aa14.61□□□□□ -0.07
FRMD6-218ENST00000557522 STK31Q9BXU1 1019 aa14.61□□□□□ -0.07
FRMD6-218ENST00000557522 CDC45O75419 566 aa14.6□□□□□ -0.07
FRMD6-218ENST00000557522 RNF214Q8ND24 703 aa14.6□□□□□ -0.07
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FRMD6-218ENST00000557522 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.6□□□□□ -0.07
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FRMD6-218ENST00000557522 GPATCH11Q8N954 259 aa14.56□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 IVLP07476 585 aa14.55□□□□□ -0.08
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FRMD6-218ENST00000557522 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.55□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 CLGNO14967 610 aa14.54□□□□□ -0.08
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FRMD6-218ENST00000557522 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.54□□□□□ -0.08
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FRMD6-218ENST00000557522 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 POTEB2H3BUK9 544 aa14.53□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 NEMFO60524 1076 aa14.53□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 KRT222Q8N1A0 295 aa14.53□□□□□ -0.08
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FRMD6-218ENST00000557522 HS1BP3Q53T59 392 aa14.53□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 CBFA2T2O43439 604 aa14.53□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 ERLIN2O94905 339 aa14.53□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 TERF1P54274 439 aa14.52□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.52□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
FRMD6-218ENST00000557522 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
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