RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-209ENST00000555009 TRPM2O94759 1503 aa24.49■■□□□ 1.51
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RPS6KL1-209ENST00000555009 CLTCL1P53675 1640 aa24.48■■□□□ 1.51
RPS6KL1-209ENST00000555009 TET3O43151 1660 aa24.48■■□□□ 1.51
RPS6KL1-209ENST00000555009 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.48■■□□□ 1.51
RPS6KL1-209ENST00000555009 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMF1P82094 1093 aa24.47■■□□□ 1.51
RPS6KL1-209ENST00000555009 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.47■■□□□ 1.51
RPS6KL1-209ENST00000555009 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RPS6KL1-209ENST00000555009 CEP152O94986 1710 aa24.46■■□□□ 1.51
RPS6KL1-209ENST00000555009 CRBNQ96SW2 442 aa24.45■■□□□ 1.51
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RPS6KL1-209ENST00000555009 CD109Q6YHK3 1445 aa24.42■■□□□ 1.5
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RPS6KL1-209ENST00000555009 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.41■■□□□ 1.5
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.41■■□□□ 1.5
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RPS6KL1-209ENST00000555009 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.35■■□□□ 1.49
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RPS6KL1-209ENST00000555009 NEFMP07197 916 aa24.34■■□□□ 1.49
RPS6KL1-209ENST00000555009 USP35Q9P2H5 1018 aa24.34■■□□□ 1.49
RPS6KL1-209ENST00000555009 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KL1-209ENST00000555009 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.33■■□□□ 1.48
RPS6KL1-209ENST00000555009 PPP2R1AP30153 589 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KL1-209ENST00000555009 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KL1-209ENST00000555009 IQGAP1P46940 1657 aa24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1-209ENST00000555009 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.31■■□□□ 1.48
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RPS6KL1-209ENST00000555009 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
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RPS6KL1-209ENST00000555009 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1-209ENST00000555009 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.28■■□□□ 1.48
RPS6KL1-209ENST00000555009 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABCA6Q8N139 1617 aa24.27■■□□□ 1.48
RPS6KL1-209ENST00000555009 MROH2AA6NES4 1674 aa24.27■■□□□ 1.47
RPS6KL1-209ENST00000555009 RAPGEF3O95398 923 aa24.26■■□□□ 1.47
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF521Q96K83 1311 aa24.26■■□□□ 1.47
RPS6KL1-209ENST00000555009 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
RPS6KL1-209ENST00000555009 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.26■■□□□ 1.47
RPS6KL1-209ENST00000555009 GOLGA2Q08379 1002 aa24.24■■□□□ 1.47
RPS6KL1-209ENST00000555009 GGT6Q6P531 493 aa24.24■■□□□ 1.47
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIF1BO60333 1816 aa24.24■■□□□ 1.47
RPS6KL1-209ENST00000555009 CDCA8Q53HL2 280 aa24.23■■□□□ 1.47
RPS6KL1-209ENST00000555009 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.23■■□□□ 1.47
RPS6KL1-209ENST00000555009 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
RPS6KL1-209ENST00000555009 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.21■■□□□ 1.47
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RPS6KL1-209ENST00000555009 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.2■■□□□ 1.47
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RPS6KL1-209ENST00000555009 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
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RPS6KL1-209ENST00000555009 IFT172Q9UG01 1749 aa24.19■■□□□ 1.46
RPS6KL1-209ENST00000555009 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.19■■□□□ 1.46
RPS6KL1-209ENST00000555009 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.19■■□□□ 1.46
RPS6KL1-209ENST00000555009 PIK3C2GO75747 1445 aa24.18■■□□□ 1.46
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RPS6KL1-209ENST00000555009 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.18■■□□□ 1.46
RPS6KL1-209ENST00000555009 STAC3Q96MF2 364 aa24.17■■□□□ 1.46
RPS6KL1-209ENST00000555009 NEO1Q92859 1461 aa24.16■■□□□ 1.46
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.16■■□□□ 1.46
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RPS6KL1-209ENST00000555009 MYOM2P54296 1465 aa24.15■■□□□ 1.46
RPS6KL1-209ENST00000555009 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.14■■□□□ 1.46
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RPS6KL1-209ENST00000555009 ADGRB3O60242 1522 aa24.13■■□□□ 1.45
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RPS6KL1-209ENST00000555009 MYOM1P52179 1685 aa24.11■■□□□ 1.45
RPS6KL1-209ENST00000555009 NOS1P29475 1434 aa24.11■■□□□ 1.45
RPS6KL1-209ENST00000555009 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.11■■□□□ 1.45
RPS6KL1-209ENST00000555009 IL27Q8NEV9 243 aa24.1■■□□□ 1.45
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RPS6KL1-209ENST00000555009 APAF1O14727 1248 aa24.09■■□□□ 1.45
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RPS6KL1-209ENST00000555009 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
RPS6KL1-209ENST00000555009 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.08■■□□□ 1.44
RPS6KL1-209ENST00000555009 RGS3P49796 1198 aa24.06■■□□□ 1.44
RPS6KL1-209ENST00000555009 PPLO60437 1756 aa24.05■■□□□ 1.44
RPS6KL1-209ENST00000555009 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.05■■□□□ 1.44
RPS6KL1-209ENST00000555009 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.05■■□□□ 1.44
RPS6KL1-209ENST00000555009 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.05■■□□□ 1.44
RPS6KL1-209ENST00000555009 BCAR3O75815 825 aa24.04■■□□□ 1.44
RPS6KL1-209ENST00000555009 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
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