RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.9■■□□□ 1.1
CS-230ENST00000551968 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CS-230ENST00000551968 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.9■■□□□ 1.1
CS-230ENST00000551968 RXRBP28702 533 aa21.89■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 BCANQ96GW7 911 aa21.88■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.88■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 NOS1P29475 1434 aa21.88■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.88■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 DIP2AQ14689 1571 aa21.87■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 ABCC5O15440 1437 aa21.86■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 ZFYVE9O95405 1425 aa21.85■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CS-230ENST00000551968 RGS12O14924 1447 aa21.82■■□□□ 1.08
CS-230ENST00000551968 KANK1Q14678 1352 aa21.82■■□□□ 1.08
CS-230ENST00000551968 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.82■■□□□ 1.08
CS-230ENST00000551968 AFF2P51816 1311 aa21.8■■□□□ 1.08
CS-230ENST00000551968 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.8■■□□□ 1.08
CS-230ENST00000551968 C14orf37Q86TY3 774 aa21.78■■□□□ 1.08
CS-230ENST00000551968 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.78■■□□□ 1.08
CS-230ENST00000551968 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.78■■□□□ 1.08
CS-230ENST00000551968 BRINP3Q76B58 766 aa21.77■■□□□ 1.08
CS-230ENST00000551968 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.77■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.76■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 DAPK1P53355 1430 aa21.75■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.75■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 TBX22Q9Y458 520 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.72■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 ATF3P18847 181 aa21.72■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.72■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-230ENST00000551968 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.7■■□□□ 1.06
CS-230ENST00000551968 PTPRUQ92729 1446 aa21.7■■□□□ 1.06
CS-230ENST00000551968 C8orf37Q96NL8 207 aa21.69■■□□□ 1.06
CS-230ENST00000551968 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CS-230ENST00000551968 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.69■■□□□ 1.06
CS-230ENST00000551968 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CS-230ENST00000551968 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.67■■□□□ 1.06
CS-230ENST00000551968 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CS-230ENST00000551968 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-230ENST00000551968 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
CS-230ENST00000551968 MST1RQ04912 1400 aa21.64■■□□□ 1.06
CS-230ENST00000551968 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-230ENST00000551968 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-230ENST00000551968 PIK3R4Q99570 1358 aa21.62■■□□□ 1.05
CS-230ENST00000551968 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CS-230ENST00000551968 TRPM2O94759 1503 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-230ENST00000551968 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CS-230ENST00000551968 UNC13BO14795 1591 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-230ENST00000551968 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CS-230ENST00000551968 EP400Q96L91 3159 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-230ENST00000551968 DCCP43146 1447 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-230ENST00000551968 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-230ENST00000551968 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
CS-230ENST00000551968 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CS-230ENST00000551968 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.58■■□□□ 1.04
CS-230ENST00000551968 ADAMTS2O95450 1211 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-230ENST00000551968 E9PCH4 1651 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-230ENST00000551968 ADGRL2O95490 1459 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-230ENST00000551968 NGLY1Q96IV0 654 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-230ENST00000551968 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-230ENST00000551968 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.52■■□□□ 1.04
CS-230ENST00000551968 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.52■■□□□ 1.04
CS-230ENST00000551968 USP21Q9UK80 565 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-230ENST00000551968 METP08581 1390 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-230ENST00000551968 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-230ENST00000551968 ATRNO75882 1429 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-230ENST00000551968 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-230ENST00000551968 LAMC1P11047 1609 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-230ENST00000551968 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CS-230ENST00000551968 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CS-230ENST00000551968 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-230ENST00000551968 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CS-230ENST00000551968 ORAI2Q96SN7 254 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-230ENST00000551968 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-230ENST00000551968 PTCH1Q13635 1447 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-230ENST00000551968 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CS-230ENST00000551968 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.39■■□□□ 1.02
CS-230ENST00000551968 FOXD1Q16676 465 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-230ENST00000551968 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CS-230ENST00000551968 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CS-230ENST00000551968 CCDC125Q86Z20 511 aa21.36■■□□□ 1.01
CS-230ENST00000551968 MYOM2P54296 1465 aa21.35■■□□□ 1.01
CS-230ENST00000551968 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.34■■□□□ 1.01
CS-230ENST00000551968 LRP5O75197 1615 aa21.33■■□□□ 1
CS-230ENST00000551968 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.32■■□□□ 1
CS-230ENST00000551968 GLI3P10071 1580 aa21.31■■□□□ 1
CS-230ENST00000551968 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CS-230ENST00000551968 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.3■■□□□ 1
CS-230ENST00000551968 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.3■■□□□ 1
CS-230ENST00000551968 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms