RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551124.5

IKZF4-211, Transcript of IKAROS family zinc finger 4, human

TSL 1 (best)

Gene IKZF4, Length 4,396 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IKZF4-211	ENST00000551124	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
IKZF4-211	ENST00000551124	PRAM1	Q96QH2	718 aa		12.03	□□□□□ -0.48
IKZF4-211	ENST00000551124	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
IKZF4-211	ENST00000551124	VPS37D	Q86XT2	251 aa		12.03	□□□□□ -0.48
IKZF4-211	ENST00000551124	SYNJ2	O15056	1496 aa		12.02	□□□□□ -0.48
IKZF4-211	ENST00000551124	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		12.02	□□□□□ -0.48
IKZF4-211	ENST00000551124	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	RAD21	O60216	631 aa		12.02	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	FBXW7	Q969H0	707 aa		12.01	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		12.01	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		12.01	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		12.01	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	RILPL2	Q969X0	211 aa		12.01	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		12.01	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	VPS53	Q5VIR6	699 aa		12.01	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		12	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	FAM177B	A6PVY3	158 aa		12	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		12	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		12	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		12	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124		E9PSI1	815 aa		12	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	PLIN1	O60240	522 aa		11.99	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		11.99	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		11.99	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	MARCH6	O60337	910 aa		11.99	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.98	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	COG6	Q9Y2V7	657 aa		11.98	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	IFT140	Q96RY7	1462 aa		11.98	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	MTHFS	P49914	203 aa		11.98	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	APP	P05067	770 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	TOP2B	Q02880	1626 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IKZF4-211	ENST00000551124	CABP1	Q9NZU7	370 aa		11.96	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	ARAP1	Q96P48	1450 aa		11.96	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	PRX	Q9BXM0	1461 aa		11.95	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	DRC7	Q8IY82	874 aa		11.95	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	KIF21B	O75037	1637 aa		11.95	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	GNAI1	P63096	354 aa		11.94	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	MIA2	Q96PC5	1412 aa		11.94	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	PRDM2	Q13029	1718 aa		11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	NCOA2	Q15596	1464 aa		11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	CDK19	Q9BWU1	502 aa		11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.92	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		11.92	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		11.91	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	KIF3A	Q9Y496	699 aa		11.9	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		11.9	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.9	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	PRKAR2B	P31323	418 aa		11.9	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		11.9	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		11.9	□□□□□ -0.5
IKZF4-211	ENST00000551124	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		11.9	□□□□□ -0.51
IKZF4-211	ENST00000551124	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.51
IKZF4-211	ENST00000551124	GBP4	Q96PP9	640 aa		11.9	□□□□□ -0.51
IKZF4-211	ENST00000551124	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.51
IKZF4-211	ENST00000551124	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.51
IKZF4-211	ENST00000551124	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		11.9	□□□□□ -0.51
IKZF4-211	ENST00000551124	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		11.89	□□□□□ -0.51
IKZF4-211	ENST00000551124	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		11.89	□□□□□ -0.51
IKZF4-211	ENST00000551124	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
IKZF4-211	ENST00000551124	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
IKZF4-211	ENST00000551124	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.89	□□□□□ -0.51
IKZF4-211	ENST00000551124	ST18	O60284	1047 aa		11.88	□□□□□ -0.51
IKZF4-211	ENST00000551124	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms