RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550047.5

SLC8B1-210, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

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Gene SLC8B1, Length 2,493 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-210ENST00000550047 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC8B1-210ENST00000550047 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC8B1-210ENST00000550047 RGS3P49796 1198 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC8B1-210ENST00000550047 ATP10AO60312 1499 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC8B1-210ENST00000550047 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SLC8B1-210ENST00000550047 SLFN5Q08AF3 891 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC8B1-210ENST00000550047 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC8B1-210ENST00000550047 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 PLXNC1O60486 1568 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 SYNMO15061 1565 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 IQGAP1P46940 1657 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 PIK3C2GO75747 1445 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 MADDQ8WXG6 1647 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 CDCA8Q53HL2 280 aa22.02■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SLC8B1-210ENST00000550047 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.01■■□□□ 1.11
SLC8B1-210ENST00000550047 BCAR3O75815 825 aa22■■□□□ 1.11
SLC8B1-210ENST00000550047 PLCH2O75038 1416 aa22■■□□□ 1.11
SLC8B1-210ENST00000550047 MYOM1P52179 1685 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC8B1-210ENST00000550047 APAF1O14727 1248 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC8B1-210ENST00000550047 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC8B1-210ENST00000550047 IGHDP01880 384 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC8B1-210ENST00000550047 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC8B1-210ENST00000550047 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SLC8B1-210ENST00000550047 E9PSI1 815 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC8B1-210ENST00000550047 USP19O94966 1318 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC8B1-210ENST00000550047 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC8B1-210ENST00000550047 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC8B1-210ENST00000550047 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC8B1-210ENST00000550047 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC8B1-210ENST00000550047 PDE3AQ14432 1141 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC8B1-210ENST00000550047 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC8B1-210ENST00000550047 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC8B1-210ENST00000550047 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SLC8B1-210ENST00000550047 CEP152O94986 1710 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 SEC24BO95487 1268 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 ABCC1P33527 1531 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 NGEFQ8N5V2 710 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 TRPM2O94759 1503 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 BECN1Q14457 450 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 STAC3Q96MF2 364 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 COG6Q9Y2V7 657 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 PANK1Q8TE04 598 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 NLRP1Q9C000 1473 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 POGKQ9P215 609 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 CLTCL1P53675 1640 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC8B1-210ENST00000550047 WWC1Q8IX03 1113 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC8B1-210ENST00000550047 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC8B1-210ENST00000550047 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC8B1-210ENST00000550047 PTPRTO14522 1441 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-210ENST00000550047 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-210ENST00000550047 ERVK-7P63135 1459 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC8B1-210ENST00000550047 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC8B1-210ENST00000550047 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SLC8B1-210ENST00000550047 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.78■■□□□ 1.08
SLC8B1-210ENST00000550047 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SLC8B1-210ENST00000550047 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.77■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 SLC24A1O60721 1099 aa21.76■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.76■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.76■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 AAMPQ13685 434 aa21.74■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 ZMYM3Q14202 1370 aa21.74■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.74■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.73■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 SHPRHQ149N8 1683 aa21.72■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.72■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 TET3O43151 1660 aa21.72■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 NEUROD2Q15784 382 aa21.71■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.71■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 DEPDC5O75140 1603 aa21.71■■□□□ 1.07
SLC8B1-210ENST00000550047 RLBP1P12271 317 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC8B1-210ENST00000550047 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC8B1-210ENST00000550047 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC8B1-210ENST00000550047 OSCARQ8IYS5 282 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC8B1-210ENST00000550047 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SLC8B1-210ENST00000550047 ABCA6Q8N139 1617 aa21.7■■□□□ 1.06
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