RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 KIF3BO15066 747 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 POGZQ7Z3K3 1410 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 PANK3Q9H999 370 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 NEO1Q92859 1461 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-205ENST00000546891 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 CD109Q6YHK3 1445 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 KIF1BO60333 1816 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 KNSTRNQ9Y448 316 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 ADGRB3O60242 1522 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 IFT172Q9UG01 1749 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 PIK3C2GO75747 1445 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 ABCA6Q8N139 1617 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-205ENST00000546891 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 RRP1P56182 461 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa13□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 CCDC136Q96JN2 1154 aa13□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 KIF13AQ9H1H9 1805 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 ABCC3O15438 1527 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 RCAN3Q9UKA8 241 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 MYOM1P52179 1685 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 NPATQ14207 1427 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 NGEFQ8N5V2 710 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 MROH2AA6NES4 1674 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 PPP2R1AP30153 589 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 UGGT1Q9NYU2 1555 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 ERVK-7P63135 1459 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 NOS1P29475 1434 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-205ENST00000546891 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 CFAP70Q5T0N1 1121 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 GLI2P10070 1586 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 PPLO60437 1756 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 PIK3C2BO00750 1634 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 FAM69CQ0P6D2 419 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 ADGRB1O14514 1584 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 ZFYVE9O95405 1425 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 USP32Q8NFA0 1604 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 VGFO15240 615 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 GGT6Q6P531 493 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-205ENST00000546891 RICTORQ6R327 1708 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 CHGAP10645 457 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 ERICH6Q7L0X2 663 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 SLC52A1Q9NWF4 448 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 ADAMTS8Q9UP79 889 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 NSD2O96028 1365 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 NINLQ9Y2I6 1382 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 DIP2BQ9P265 1576 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 QRICH2Q9H0J4 1663 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 TSPOAP1O95153 1857 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 GOLGA2Q08379 1002 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 ZNF521Q96K83 1311 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 REREQ9P2R6 1566 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 MS4A1P11836 297 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 EVC2Q86UK5 1308 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 EXOC6Q8TAG9 804 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 NSD3Q9BZ95 1437 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 CGNL1Q0VF96 1302 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-205ENST00000546891 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 E9PSI1 815 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 DUSP27Q5VZP5 1158 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 TRAK1Q9UPV9 953 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms