RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 ZNF516Q92618 1163 aa11.52□□□□□ -0.57
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TRDN-204ENST00000542443 GNPATO15228 680 aa11.49□□□□□ -0.57
TRDN-204ENST00000542443 OATP04181 439 aa11.49□□□□□ -0.57
TRDN-204ENST00000542443 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.49□□□□□ -0.57
TRDN-204ENST00000542443 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TRDN-204ENST00000542443 GPR37O15354 613 aa11.47□□□□□ -0.57
TRDN-204ENST00000542443 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.47□□□□□ -0.57
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TRDN-204ENST00000542443 SLC10A3P09131 477 aa11.42□□□□□ -0.58
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TRDN-204ENST00000542443 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.42□□□□□ -0.58
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TRDN-204ENST00000542443 THAP11Q96EK4 314 aa11.13□□□□□ -0.63
TRDN-204ENST00000542443 SPRYD7Q5W111 196 aa11.11□□□□□ -0.63
TRDN-204ENST00000542443 KDM4AO75164 1064 aa11.1□□□□□ -0.63
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TRDN-204ENST00000542443 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.1□□□□□ -0.63
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TRDN-204ENST00000542443 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
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TRDN-204ENST00000542443 USP46P62068 366 aa11.04□□□□□ -0.64
TRDN-204ENST00000542443 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TRDN-204ENST00000542443 TNFRSF10AO00220 468 aa11.02□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.02□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 HOXA2O43364 376 aa11.01□□□□□ -0.65
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