RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539034.1

CLIP1-AS1-202, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLIP1-AS1, Length 447 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PXYLP1Q8TE99 480 aa10.09□□□□□ -0.79
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.09□□□□□ -0.79
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ADGRG1Q9Y653 693 aa10.09□□□□□ -0.79
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MCM6Q14566 821 aa10.08□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ARID3CA6NKF2 412 aa10.07□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TTC13Q8NBP0 860 aa10.07□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ARID3AQ99856 593 aa10.07□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KIAA1468Q9P260 1216 aa10.06□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 A6NJR5 290 aa10.05□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GOLGA8CPA6NN73 597 aa10.05□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CLUAP1Q96AJ1 413 aa10.05□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 APBB1O00213 710 aa10.04□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.04□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MYSM1Q5VVJ2 828 aa10.03□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NBPF3Q9H094 633 aa10.03□□□□□ -0.8
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.02□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 POLR3EQ9NVU0 708 aa10.02□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRSS12P56730 875 aa10.01□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRAK2O60296 914 aa10□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 WNT2BQ93097 391 aa10□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CDCA7LQ96GN5 454 aa10□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TSKSQ9UJT2 592 aa10□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PTPN5P54829 565 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PACS2Q86VP3 889 aa9.98□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.98□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HCSTQ9UBK5 93 aa9.98□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.98□□□□□ -0.81
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SMAPO00193 183 aa9.96□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.95□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 C3orf80F5H4A9 247 aa9.94□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.94□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.94□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 POM121Q96HA1 1249 aa9.94□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RCCD1A6NED2 376 aa9.93□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.93□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RFC5P40937 340 aa9.93□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.93□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ANKK1Q8NFD2 765 aa9.93□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.93□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BCAMP50895 628 aa9.92□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EYA1Q99502 592 aa9.92□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PNMA3Q9UL41 463 aa9.92□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RAD21O60216 631 aa9.91□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CD46P15529 392 aa9.91□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.91□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TATDN2Q93075 761 aa9.91□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.9□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BANK1Q8NDB2 785 aa9.9□□□□□ -0.82
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.89□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NBPF26B4DH59 902 aa9.88□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.88□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SULF1Q8IWU6 871 aa9.88□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.88□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 COG6Q9Y2V7 657 aa9.88□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DNAJB2P25686 324 aa9.87□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SNRKQ9NRH2 765 aa9.87□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.86□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.86□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPTLC1O15269 473 aa9.86□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.86□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.86□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LRCH3Q96II8 777 aa9.85□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.85□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.84□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.84□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.84□□□□□ -0.83
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.83□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.83□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 WBP1LQ9NX94 342 aa9.83□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.83□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.82□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GJA5P36382 358 aa9.81□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 QPCTQ16769 361 aa9.81□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RNF40O75150 1001 aa9.8□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NDUFV2P19404 249 aa9.8□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.8□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SOCS7O14512 581 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms