RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530935.1

TMX4-204, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene TMX4, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-204ENST00000530935 C3orf80F5H4A9 247 aa7.39□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 EYA1Q99502 592 aa7.39□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 TSKSQ9UJT2 592 aa7.39□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 FLIIQ13045 1269 aa7.38□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.38□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 RCCD1A6NED2 376 aa7.37□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 MMRN1Q13201 1228 aa7.37□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 PROX2Q3B8N5 592 aa7.37□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.37□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX4-204ENST00000530935 CD46P15529 392 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 DNAJB2P25686 324 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 TATDN2Q93075 761 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 PNMA3Q9UL41 463 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 NBPF26B4DH59 902 aa7.32□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 MCM6Q14566 821 aa7.32□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 NBPF3Q9H094 633 aa7.32□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.31□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 PACS2Q86VP3 889 aa7.31□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.31□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 SMAPO00193 183 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 STAC3Q96MF2 364 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.29□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 SULF1Q8IWU6 871 aa7.29□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 HOMEZQ8IX15 550 aa7.29□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 A6NJR5 290 aa7.28□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.28□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.28□□□□□ -1.24
TMX4-204ENST00000530935 SPTLC1O15269 473 aa7.27□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.27□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 RFC5P40937 340 aa7.26□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.26□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.26□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 MOXD2PA6NHM9 499 aa7.25□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.25□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.24□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.24□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 TRAK2O60296 914 aa7.24□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 BANK1Q8NDB2 785 aa7.24□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 ARID3CA6NKF2 412 aa7.23□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 NDUFV2P19404 249 aa7.23□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 GJA5P36382 358 aa7.23□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 WNT2BQ93097 391 aa7.23□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 POM121Q96HA1 1249 aa7.23□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 SNRKQ9NRH2 765 aa7.23□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 APBB1O00213 710 aa7.22□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 KDM4AO75164 1064 aa7.22□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 SLC10A3P09131 477 aa7.22□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 GCGRP47871 477 aa7.22□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.22□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.22□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 RDH13Q8NBN7 331 aa7.22□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.22□□□□□ -1.25
TMX4-204ENST00000530935 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.21□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 LILRB3O75022 631 aa7.21□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 QPCTQ16769 361 aa7.21□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.21□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.2□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 HCSTQ9UBK5 93 aa7.2□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 COG6Q9Y2V7 657 aa7.2□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 HOXA2O43364 376 aa7.19□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 USP46P62068 366 aa7.19□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.19□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.18□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.18□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 ARID3AQ99856 593 aa7.18□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 RAD21O60216 631 aa7.17□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 BCAMP50895 628 aa7.17□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.17□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TMX4-204ENST00000530935 LRCH3Q96II8 777 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms