RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525151.5

TRAF3IP2-AS1-208, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 609 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RXRBP28702 533 aa27.22■■□□□ 1.95
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TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.63■■□□□ 1.85
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TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PTCH1Q13635 1447 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FOXD1Q16676 465 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CCDC125Q86Z20 511 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MYOM2P54296 1465 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ORAI2Q96SN7 254 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GLI3P10071 1580 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.45■■□□□ 1.82
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