RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524784.1

PACS1-202, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 540 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-202ENST00000524784 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.95□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 PTPRMP28827 1452 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 ZFYVE9O95405 1425 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 PPLO60437 1756 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 EID1Q9Y6B2 187 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-202ENST00000524784 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 IFT172Q9UG01 1749 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 BCANQ96GW7 911 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 PIK3C2GO75747 1445 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 USP47Q96K76 1375 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PACS1-202ENST00000524784 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 LTKP29376 864 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 SLIT1O75093 1534 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 LAMC1P11047 1609 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.8□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.8□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 SLC24A1O60721 1099 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 ALKQ9UM73 1620 aa14.77□□□□□ -0.04
PACS1-202ENST00000524784 STK26Q9P289 416 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 TBX22Q9Y458 520 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 ADGRB1O14514 1584 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 TMF1P82094 1093 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 POGKQ9P215 609 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 IQGAP1P46940 1657 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 CDCA8Q53HL2 280 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 TESK2Q96S53 571 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 METP08581 1390 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PACS1-202ENST00000524784 ABCC11Q96J66 1382 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 CCDC7Q96M83 1385 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 SIRT1Q96EB6 747 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 PRAM1Q96QH2 718 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 MED14O60244 1454 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 HSPA2P54652 639 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 DIP2AQ14689 1571 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 PIK3R4Q99570 1358 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 DLC1Q96QB1 1528 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 EVC2Q86UK5 1308 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-202ENST00000524784 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-202ENST00000524784 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-202ENST00000524784 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-202ENST00000524784 TECPR2O15040 1411 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-202ENST00000524784 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-202ENST00000524784 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PACS1-202ENST00000524784 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PACS1-202ENST00000524784 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PACS1-202ENST00000524784 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-202ENST00000524784 PTPRUQ92729 1446 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-202ENST00000524784 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-202ENST00000524784 KCNA6P17658 529 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-202ENST00000524784 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-202ENST00000524784 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.6□□□□□ -0.07
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