RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522969.1

ARHGEF10-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ARHGEF10, Length 2,349 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10-211ENST00000522969 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF10-211ENST00000522969 ABCA6Q8N139 1617 aa22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF10-211ENST00000522969 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF10-211ENST00000522969 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF10-211ENST00000522969 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF10-211ENST00000522969 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF10-211ENST00000522969 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF10-211ENST00000522969 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF10-211ENST00000522969 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF10-211ENST00000522969 ADGRL2O95490 1459 aa22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF10-211ENST00000522969 PKD2Q13563 968 aa22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF10-211ENST00000522969 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF10-211ENST00000522969 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF10-211ENST00000522969 CRBNQ96SW2 442 aa22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF10-211ENST00000522969 A2MP01023 1474 aa22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF10-211ENST00000522969 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF10-211ENST00000522969 FAM161AQ3B820 660 aa22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF10-211ENST00000522969 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF10-211ENST00000522969 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF10-211ENST00000522969 KIF3BO15066 747 aa22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF10-211ENST00000522969 GGT6Q6P531 493 aa22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF10-211ENST00000522969 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF10-211ENST00000522969 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF10-211ENST00000522969 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF10-211ENST00000522969 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF10-211ENST00000522969 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF10-211ENST00000522969 PLIN1O60240 522 aa22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF10-211ENST00000522969 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF10-211ENST00000522969 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF10-211ENST00000522969 PLXNC1O60486 1568 aa22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF10-211ENST00000522969 SLC4A3P48751 1232 aa22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF10-211ENST00000522969 C8orf34Q49A92 452 aa22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF10-211ENST00000522969 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF10-211ENST00000522969 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF10-211ENST00000522969 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF10-211ENST00000522969 REREQ9P2R6 1566 aa22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF10-211ENST00000522969 AGLP35573 1532 aa22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF10-211ENST00000522969 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF10-211ENST00000522969 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF10-211ENST00000522969 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF10-211ENST00000522969 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF10-211ENST00000522969 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF10-211ENST00000522969 SKAP1Q86WV1 359 aa22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF10-211ENST00000522969 NUP155O75694 1391 aa22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF10-211ENST00000522969 DCAF11Q8TEB1 546 aa22■■□□□ 1.11
ARHGEF10-211ENST00000522969 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF10-211ENST00000522969 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF10-211ENST00000522969 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF10-211ENST00000522969 MADDQ8WXG6 1647 aa21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF10-211ENST00000522969 ERBINQ96RT1 1412 aa21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF10-211ENST00000522969 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF10-211ENST00000522969 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF10-211ENST00000522969 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF10-211ENST00000522969 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF10-211ENST00000522969 LAMC1P11047 1609 aa21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF10-211ENST00000522969 PTPRMP28827 1452 aa21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF10-211ENST00000522969 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF10-211ENST00000522969 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF10-211ENST00000522969 BECN1Q14457 450 aa21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF10-211ENST00000522969 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF10-211ENST00000522969 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF10-211ENST00000522969 ZMYM3Q14202 1370 aa21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF10-211ENST00000522969 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ARHGEF10-211ENST00000522969 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
ARHGEF10-211ENST00000522969 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ARHGEF10-211ENST00000522969 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.9■■□□□ 1.1
ARHGEF10-211ENST00000522969 GOLGA2Q08379 1002 aa21.89■■□□□ 1.1
ARHGEF10-211ENST00000522969 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.88■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 RGS3P49796 1198 aa21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 PANK3Q9H999 370 aa21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 ZNF521Q96K83 1311 aa21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 TMF1P82094 1093 aa21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 TESK2Q96S53 571 aa21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 ABCC3O15438 1527 aa21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 POGKQ9P215 609 aa21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 USP19O94966 1318 aa21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 SLFN5Q08AF3 891 aa21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 KANK1Q14678 1352 aa21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 DEPDC5O75140 1603 aa21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
ARHGEF10-211ENST00000522969 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF10-211ENST00000522969 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms