RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa10.36□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 HOMEZQ8IX15 550 aa10.35□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 PLA2R1Q13018 1463 aa10.35□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa10.34□□□□□ -0.75
TRPS1-208ENST00000519076 MAST1Q9Y2H9 1570 aa10.33□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 DISP3Q9P2K9 1392 aa10.33□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 ZBED9Q6R2W3 1325 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 IDI1Q13907 227 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 TESK2Q96S53 571 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 KDM5DQ9BY66 1539 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 NEUROD2Q15784 382 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 MORC1Q86VD1 984 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 PLXNC1O60486 1568 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 NOS1P29475 1434 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 POGZQ7Z3K3 1410 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 SLC52A1Q9NWF4 448 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 ATP10AO60312 1499 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC146Q8IYE0 955 aa10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 NUDCQ9Y266 331 aa10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-208ENST00000519076 ARAP3Q8WWN8 1544 aa10.27□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 ABCA9Q8IUA7 1624 aa10.27□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 UGGT1Q9NYU2 1555 aa10.27□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 CABP2Q9NPB3 220 aa10.27□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 UNC13BO14795 1591 aa10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 YEATS2Q9ULM3 1422 aa10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 EVC2Q86UK5 1308 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 KDM5CP41229 1560 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 BRD2P25440 801 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 CFAP53Q96M91 514 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 PPP4R2Q9NY27 417 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 NPATQ14207 1427 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 CANXP27824 592 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 NBR1Q14596 966 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 ADAMTS8Q9UP79 889 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 NUTM2FA1L443 756 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 PPP2R1AP30153 589 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 GPRASP1Q5JY77 1395 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 NEO1Q92859 1461 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 HDGFP51858 240 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 BCORL1Q5H9F3 1711 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 PRAM1Q96QH2 718 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 NEFMP07197 916 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 TSPOAP1O95153 1857 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 MLH3Q9UHC1 1453 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.21□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 PTPRTO14522 1441 aa10.21□□□□□ -0.77
TRPS1-208ENST00000519076 TRPM2O94759 1503 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 APAF1O14727 1248 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 TERF2IPQ9NYB0 399 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 E9PCH4 1651 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 SOX12O15370 315 aa10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 GGNBP2Q9H3C7 697 aa10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 HECW2Q9P2P5 1572 aa10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 MAGI2Q86UL8 1455 aa10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 TET3O43151 1660 aa10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 CFAP74Q9C0B2 1584 aa10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 CLTCL1P53675 1640 aa10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 PLIN1O60240 522 aa10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa10.17□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA2Q08379 1002 aa10.17□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 PDE3BQ13370 1112 aa10.17□□□□□ -0.78
TRPS1-208ENST00000519076 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.17□□□□□ -0.78
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