RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516525.1

RNU6-1337P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1337, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1337P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PRR14Q9BWN1 585 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 APLP1P51693 650 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MAP2K5Q13163 448 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RSPH4AQ5TD94 716 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 A0A0G2JS52 829 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KMT5BQ4FZB7 885 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TJAP1Q5JTD0 557 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LMOD2Q6P5Q4 547 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MTRQ99707 1265 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IL21Q9HBE4 155 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RGS20O76081 388 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IRF6O14896 467 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLC24A1O60721 1099 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CFHP08603 1231 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SULF1Q8IWU6 871 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DDX11L8A8MPP1 907 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLC10A3P09131 477 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 COPS2P61201 443 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RDH13Q8NBN7 331 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NLRP7Q8WX94 980 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PHOX2BQ99453 314 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZNF516Q92618 1163 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CCDC102AQ96A19 550 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZPR1O75312 459 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZMYND10O75800 440 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NR1I2O75469 434 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GGCXP38435 758 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BARGINQ6ZT62 677 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CLCN1P35523 988 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GCGRP47871 477 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PPP1R18Q6NYC8 613 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NKX2-3Q8TAU0 364 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FUT2Q10981 343 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GRIPAP1Q4V328 841 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BCANQ96GW7 911 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GPCPD1Q9NPB8 672 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CD46P15529 392 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ATP6V1AP38606 617 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMUB1Q9BVT8 246 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TLL1O43897 1013 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MORN1Q5T089 497 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KDM4AO75164 1064 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ADH1BP00325 375 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AMHR2Q16671 573 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AK7Q96M32 723 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLC6A16Q9GZN6 736 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 S1PR4O95977 384 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 USP46P62068 366 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SPSB2Q99619 263 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PRKD2Q9BZL6 878 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 V9GY48 417 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RNF223E7ERA6 249 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 Q3C1V9 767 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NUTM1Q86Y26 1132 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ANKLE1Q8NAG6 615 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRIM66O15016 1216 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 THAP11Q96EK4 314 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HOXA2O43364 376 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BRICD5Q6PL45 260 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLC24A3Q9HC58 644 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLC19A1P41440 591 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MSS51Q4VC12 460 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PARP9Q8IXQ6 854 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PDE4DQ08499 809 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LAPTM4AQ15012 233 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DIXDC1Q155Q3 683 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1337P-201ENST00000516525 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BEGAINQ9BUH8 593 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SPIRE2Q8WWL2 714 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HLA-CQ95604 372 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PRDM9Q9NQV7 894 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GFRA3O60609 400 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FDX1P10109 184 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MS4A1P11836 297 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms