RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	PNMA3	Q9UL41	463 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PDE4D-222	ENST00000514552	EYA1	Q99502	592 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PDE4D-222	ENST00000514552	WIZ	O95785	1651 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PDE4D-222	ENST00000514552	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PDE4D-222	ENST00000514552	C3orf80	F5H4A9	247 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PDE4D-222	ENST00000514552	NBPF3	Q9H094	633 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PDE4D-222	ENST00000514552	WDR62	O43379	1518 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PDE4D-222	ENST00000514552	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PDE4D-222	ENST00000514552	HR	O43593	1189 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PDE4D-222	ENST00000514552	AMHR2	Q16671	573 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PDE4D-222	ENST00000514552	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PDE4D-222	ENST00000514552	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	SMAP	O00193	183 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	PHOX2B	Q99453	314 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	PDE4D	Q08499	809 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	RCCD1	A6NED2	376 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAJB2	P25686	324 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	STAC3	Q96MF2	364 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	CFTR	P13569	1480 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	CLCN1	P35523	988 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PDE4D-222	ENST00000514552	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
PDE4D-222	ENST00000514552	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PDE4D-222	ENST00000514552	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
PDE4D-222	ENST00000514552	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PDE4D-222	ENST00000514552	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PDE4D-222	ENST00000514552	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PDE4D-222	ENST00000514552	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PDE4D-222	ENST00000514552	NEUROD2	Q15784	382 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PDE4D-222	ENST00000514552	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PDE4D-222	ENST00000514552	NLRP7	Q8WX94	980 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PDE4D-222	ENST00000514552	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PDE4D-222	ENST00000514552	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PDE4D-222	ENST00000514552	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	PRDM2	Q13029	1718 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC4A3	P48751	1232 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	SULF1	Q8IWU6	871 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	SLF2	Q8IX21	1173 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	LRCH3	Q96II8	777 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	WNT2B	Q93097	391 aa		12.59	□□□□□ -0.39
PDE4D-222	ENST00000514552	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
PDE4D-222	ENST00000514552	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
PDE4D-222	ENST00000514552	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
PDE4D-222	ENST00000514552	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		12.57	□□□□□ -0.4
PDE4D-222	ENST00000514552	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		12.57	□□□□□ -0.4
PDE4D-222	ENST00000514552	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PDE4D-222	ENST00000514552	MS4A1	P11836	297 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PDE4D-222	ENST00000514552	NECTIN2	Q92692	538 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PDE4D-222	ENST00000514552	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PDE4D-222	ENST00000514552	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PDE4D-222	ENST00000514552	CD46	P15529	392 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF40	O75150	1001 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	BCAM	P50895	628 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	RDH13	Q8NBN7	331 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC10A3	P09131	477 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	IFT140	Q96RY7	1462 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ABCC8	Q09428	1581 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM117A	Q9C073	453 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	PPP4C	P60510	307 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	GCGR	P47871	477 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PDE4D-222	ENST00000514552	TOPBP1	Q92547	1522 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	CFH	P08603	1231 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	IL27	Q8NEV9	243 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	PRR14	Q9BWN1	585 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	WBP1L	Q9NX94	342 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	KDM4A	O75164	1064 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	USP46	P62068	366 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42

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