RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	DRC7	Q8IY82	874 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	COG3	Q96JB2	828 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	HMOX1	P09601	288 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	STAC3	Q96MF2	364 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	ST18	O60284	1047 aa		10	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	DAPK1	P53355	1430 aa		10	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		10	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		10	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	SKAP1	Q86WV1	359 aa		10	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	RILPL2	Q969X0	211 aa		10	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	HMGXB3	Q12766	1538 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	NECTIN2	Q92692	538 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	EID1	Q9Y6B2	187 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		9.96	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.81
NEK1-208	ENST00000512193	NRDC	O43847	1150 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	KIF16B	Q96L93	1317 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	PDE3A	Q14432	1141 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		9.94	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	SYNJ2	O15056	1496 aa		9.94	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	9.94	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	IL27	Q8NEV9	243 aa		9.94	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	9.94	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	GNAI1	P63096	354 aa		9.93	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		9.93	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	ROCK1	Q13464	1354 aa		9.93	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	ABCC5	O15440	1437 aa		9.93	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		9.93	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	9.93	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	GPATCH3	Q96I76	525 aa		9.93	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	MAP3K1	Q13233	1512 aa		9.93	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	REC8	O95072	547 aa		9.92	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	9.92	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	PRKAR2B	P31323	418 aa		9.92	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	9.92	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	AAMP	Q13685	434 aa		9.92	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		9.92	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	NCOA1	Q15788	1441 aa		9.92	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		9.92	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	9.92	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	NPHP1	O15259	732 aa		9.91	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	9.91	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	GORAB	Q5T7V8	394 aa		9.91	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		9.91	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		9.91	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		9.91	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	9.91	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	PTPRK	Q15262	1439 aa		9.91	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	HECW1	Q76N89	1606 aa		9.91	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	SLFN5	Q08AF3	891 aa		9.91	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	TEF	Q10587	303 aa		9.91	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	MAPKBP1	O60336	1514 aa		9.9	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		9.9	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		9.9	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		9.9	□□□□□ -0.82
NEK1-208	ENST00000512193	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		9.9	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	PRAM1	Q96QH2	718 aa		9.9	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	9.89	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	9.89	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		9.89	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	WWC1	Q8IX03	1113 aa		9.89	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		9.89	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	9.89	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	TRAK2	O60296	914 aa		9.89	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	9.89	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	MCTP1	Q6DN14	999 aa		9.88	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		9.88	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		9.88	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		9.88	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	9.88	□□□□□ -0.83
NEK1-208	ENST00000512193	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	9.88	□□□□□ -0.83

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