RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.64■■■■□ 3.3
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SH3BP2-221ENST00000511747 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.63■■■■□ 3.29
SH3BP2-221ENST00000511747 DUSP27Q5VZP5 1158 aa35.62■■■■□ 3.29
SH3BP2-221ENST00000511747 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.62■■■■□ 3.29
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF521Q96K83 1311 aa35.59■■■■□ 3.29
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SH3BP2-221ENST00000511747 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.07■■■■□ 3.2
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SH3BP2-221ENST00000511747 NEUROD2Q15784 382 aa35.01■■■■□ 3.19
SH3BP2-221ENST00000511747 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.99■■■■□ 3.19
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.99■■■■□ 3.19
SH3BP2-221ENST00000511747 ADGRB3O60242 1522 aa34.99■■■■□ 3.19
SH3BP2-221ENST00000511747 CANXP27824 592 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
SH3BP2-221ENST00000511747 RUNDC1Q96C34 613 aa34.99■■■■□ 3.19
SH3BP2-221ENST00000511747 PANK1Q8TE04 598 aa34.98■■■■□ 3.19
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