RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504624.1

PDE4D-211, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-211ENST00000504624 VSIG10Q8N0Z9 540 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF516Q92618 1163 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 PTGDRQ13258 359 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 TTC13Q8NBP0 860 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 FECHP22830 423 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF787Q6DD87 383 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 NKX2-3Q8TAU0 364 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 EYA1Q99502 592 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 TMUB1Q9BVT8 246 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 ZPR1O75312 459 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 LCE2BO14633 110 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 SLC24A1O60721 1099 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 FCHSD2O94868 740 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 SLC19A1P41440 591 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 PKDCCQ504Y2 493 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 ADGRG1Q9Y653 693 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 KMT5BQ4FZB7 885 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 SMYD5Q6GMV2 418 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 NLRP7Q8WX94 980 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 DNAJB2P25686 324 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-211ENST00000504624 RCCD1A6NED2 376 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 RNF223E7ERA6 249 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 GPR37O15354 613 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 GNPATO15228 680 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 TLL1O43897 1013 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 NR1I2O75469 434 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 CFHP08603 1231 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 HIC1Q14526 733 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 DGAT1O75907 488 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 S1PR4O95977 384 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 GPIHBP1Q8IV16 184 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 FAM187AA6NFU0 413 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 RSPH4AQ5TD94 716 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF697Q5TEC3 545 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 ANKLE1Q8NAG6 615 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 PHOX2BQ99453 314 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM134Q9H6X4 195 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 TNFRSF10AO00220 468 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 ADH1BP00325 375 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 OATP04181 439 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 SLC10A3P09131 477 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 SPRYD7Q5W111 196 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-211ENST00000504624 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 SLC6A16Q9GZN6 736 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 PRR20EP86478 221 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 PRR20CP86479 221 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 PRR20DP86480 221 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 PRR20BP86481 221 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 PRR20AP86496 221 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 MYT1Q01538 1121 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 TRIM67Q6ZTA4 783 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 DDX11L8A8MPP1 907 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 FOXC1Q12948 553 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 LIAT1Q6ZQX7 453 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 RDH13Q8NBN7 331 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 IRF6O14896 467 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 LMOD2Q6P5Q4 547 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 SPSB2Q99619 263 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-211ENST00000504624 ST8SIA5O15466 376 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 SCUBE3Q8IX30 993 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 CYP4X1Q8N118 509 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 POTECB2RU33 542 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 GDF9O60383 454 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 MAP2K5Q13163 448 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 RPIAP49247 311 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 FUT2Q10981 343 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 PLA2G2CQ5R387 149 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 CCDC102AQ96A19 550 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 AAASQ9NRG9 546 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 AXIN1O15169 862 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 GCGRP47871 477 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 SULF1Q8IWU6 871 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 GRIPAP1Q4V328 841 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 MORN1Q5T089 497 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-211ENST00000504624 TREML4Q6UXN2 200 aa5.65□□□□□ -1.5
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