RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.33□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.33□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 POTEDQ86YR6 584 aa11.33□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 ABCC3O15438 1527 aa11.33□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 NPATQ14207 1427 aa11.31□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 MYOM2P54296 1465 aa11.31□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 ADGRB3O60242 1522 aa11.3□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 PTPRMP28827 1452 aa11.29□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 ZMYM3Q14202 1370 aa11.29□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 PPLO60437 1756 aa11.29□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.29□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 C3P01024 1663 aa11.28□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 PIK3C2BO00750 1634 aa11.28□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 TESK2Q96S53 571 aa11.28□□□□□ -0.6
PDE4D-208ENST00000502484 NRXN1Q9ULB1 1477 aa11.27□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 NOS1P29475 1434 aa11.27□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.27□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC184Q52MB2 194 aa11.26□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 SYNMO15061 1565 aa11.26□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.25□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 MRS2Q9HD23 443 aa11.24□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.23□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 TMF1P82094 1093 aa11.23□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa11.23□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.22□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.22□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PDE4D-208ENST00000502484 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.614e-6■□□□□ 11.2
PDE4D-208ENST00000502484 MYO5BQ9ULV0 1848 aa11.21□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa11.2□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 PIK3C2GO75747 1445 aa11.2□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 ERVK-7P63135 1459 aa11.2□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 MYOM1P52179 1685 aa11.2□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 TNRQ92752 1358 aa11.19□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.19□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 RALBP1Q15311 655 aa11.19□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.19□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.18□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.18□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.17□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 ADGRB1O14514 1584 aa11.17□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa11.17□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 CDCA8Q53HL2 280 aa11.17□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 SLC24A1O60721 1099 aa11.16□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.16□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa11.15□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 PANK3Q9H999 370 aa11.15□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.15□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 QRICH2Q9H0J4 1663 aa11.15□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PDE4D-208ENST00000502484 NLRP1Q9C000 1473 aa11.15□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 IDI1Q13907 227 aa11.14□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 ZFYVE9O95405 1425 aa11.14□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.14□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 TMC1Q8TDI8 760 aa11.13□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 A2ML1A8K2U0 1454 aa11.12□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.12□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 NLRP13Q86W25 1043 aa11.12□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 HSPA2P54652 639 aa11.1□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 UBR1Q8IWV7 1749 aa11.1□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.09□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PDE4D-208ENST00000502484 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa11.08□□□□□ -0.64
PDE4D-208ENST00000502484 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.08□□□□□ -0.64
PDE4D-208ENST00000502484 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.08□□□□□ -0.64
PDE4D-208ENST00000502484 NEFLP07196 543 aa11.07□□□□□ -0.64
PDE4D-208ENST00000502484 FKBP8Q14318 412 aa11.07□□□□□ -0.64
PDE4D-208ENST00000502484 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM132EQ6IEE7 984 aa11.07□□□□□ -0.64
PDE4D-208ENST00000502484 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PDE4D-208ENST00000502484 INSRP06213 1382 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM2Q9UHN6 1383 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4D-208ENST00000502484 ALKQ9UM73 1620 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4D-208ENST00000502484 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PDE4D-208ENST00000502484 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4D-208ENST00000502484 EID1Q9Y6B2 187 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.4 ms