RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.32■■■■□ 3.41
HOXB3-212ENST00000498678 ERVK-7P63135 1459 aa36.31■■■■□ 3.4
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HOXB3-212ENST00000498678 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.29■■■■□ 3.4
HOXB3-212ENST00000498678 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
HOXB3-212ENST00000498678 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.27■■■■□ 3.4
HOXB3-212ENST00000498678 PPLO60437 1756 aa36.26■■■■□ 3.4
HOXB3-212ENST00000498678 ANP32CO43423 234 aa36.22■■■■□ 3.39
HOXB3-212ENST00000498678 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.2■■■■□ 3.39
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HOXB3-212ENST00000498678 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.2■■■■□ 3.39
HOXB3-212ENST00000498678 ZMYM3Q14202 1370 aa36.18■■■■□ 3.38
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HOXB3-212ENST00000498678 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-212ENST00000498678 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-212ENST00000498678 TESK2Q96S53 571 aa36.16■■■■□ 3.38
HOXB3-212ENST00000498678 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
HOXB3-212ENST00000498678 PIK3C2GO75747 1445 aa36.15■■■■□ 3.38
HOXB3-212ENST00000498678 POLR3GLQ9BT43 218 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXB3-212ENST00000498678 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
HOXB3-212ENST00000498678 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.1■■■■□ 3.37
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HOXB3-212ENST00000498678 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
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HOXB3-212ENST00000498678 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.05■■■■□ 3.36
HOXB3-212ENST00000498678 CCER2I3L3R5 266 aa36.04■■■■□ 3.36
HOXB3-212ENST00000498678 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.02■■■■□ 3.36
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HOXB3-212ENST00000498678 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.98■■■■□ 3.35
HOXB3-212ENST00000498678 ADGRB1O14514 1584 aa35.98■■■■□ 3.35
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HOXB3-212ENST00000498678 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.91■■■■□ 3.34
HOXB3-212ENST00000498678 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
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HOXB3-212ENST00000498678 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.86■■■■□ 3.33
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HOXB3-212ENST00000498678 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.85■■■■□ 3.33
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HOXB3-212ENST00000498678 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.84■■■■□ 3.33
HOXB3-212ENST00000498678 SLC24A1O60721 1099 aa35.82■■■■□ 3.32
HOXB3-212ENST00000498678 CDCA8Q53HL2 280 aa35.81■■■■□ 3.32
HOXB3-212ENST00000498678 C3P01024 1663 aa35.81■■■■□ 3.32
HOXB3-212ENST00000498678 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
HOXB3-212ENST00000498678 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.79■■■■□ 3.32
HOXB3-212ENST00000498678 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
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HOXB3-212ENST00000498678 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXB3-212ENST00000498678 ALKQ9UM73 1620 aa35.75■■■■□ 3.31
HOXB3-212ENST00000498678 NLRP1Q9C000 1473 aa35.74■■■■□ 3.31
HOXB3-212ENST00000498678 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.74■■■■□ 3.31
HOXB3-212ENST00000498678 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.73■■■■□ 3.31
HOXB3-212ENST00000498678 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
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HOXB3-212ENST00000498678 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
HOXB3-212ENST00000498678 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.69■■■■□ 3.3
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HOXB3-212ENST00000498678 CCDC184Q52MB2 194 aa35.66■■■■□ 3.3
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HOXB3-212ENST00000498678 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
HOXB3-212ENST00000498678 STK26Q9P289 416 aa35.65■■■■□ 3.3
HOXB3-212ENST00000498678 PTPRMP28827 1452 aa35.63■■■■□ 3.29
HOXB3-212ENST00000498678 MYOM1P52179 1685 aa35.62■■■■□ 3.29
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HOXB3-212ENST00000498678 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
HOXB3-212ENST00000498678 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
HOXB3-212ENST00000498678 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
HOXB3-212ENST00000498678 RALBP1Q15311 655 aa35.57■■■■□ 3.28
HOXB3-212ENST00000498678 MRS2Q9HD23 443 aa35.57■■■■□ 3.28
HOXB3-212ENST00000498678 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.55■■■■□ 3.28
HOXB3-212ENST00000498678 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
HOXB3-212ENST00000498678 PARD3Q8TEW0 1356 aa35.51■■■■□ 3.28
HOXB3-212ENST00000498678 LTKP29376 864 aa35.51■■■■□ 3.27
HOXB3-212ENST00000498678 PRAM1Q96QH2 718 aa35.51■■■■□ 3.27
HOXB3-212ENST00000498678 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.5■■■■□ 3.27
HOXB3-212ENST00000498678 EVC2Q86UK5 1308 aa35.5■■■■□ 3.27
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HOXB3-212ENST00000498678 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.48■■■■□ 3.27
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HOXB3-212ENST00000498678 KNSTRNQ9Y448 316 aa35.47■■■■□ 3.27
HOXB3-212ENST00000498678 DLC1Q96QB1 1528 aa35.47■■■■□ 3.27
HOXB3-212ENST00000498678 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.47■■■■□ 3.27
HOXB3-212ENST00000498678 ABCC11Q96J66 1382 aa35.46■■■■□ 3.27
HOXB3-212ENST00000498678 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.46■■■■□ 3.27
HOXB3-212ENST00000498678 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
HOXB3-212ENST00000498678 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
HOXB3-212ENST00000498678 BCANQ96GW7 911 aa35.44■■■■□ 3.26
HOXB3-212ENST00000498678 EID1Q9Y6B2 187 aa35.44■■■■□ 3.26
HOXB3-212ENST00000498678 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.42■■■■□ 3.26
HOXB3-212ENST00000498678 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
HOXB3-212ENST00000498678 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
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