RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	ADGRL1	O94910	1474 aa		8.45	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		8.45	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPY4	P0CV99	314 aa		8.45	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPY10	P0CW01	314 aa		8.45	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		8.45	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	8.45	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	MIA2	Q96PC5	1412 aa		8.45	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		8.44	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		8.44	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	8.43	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		8.43	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	8.43	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCC5	O15440	1437 aa		8.43	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		8.43	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		8.43	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	8.43	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		8.43	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		8.43	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	MLEC	Q14165	292 aa		8.42	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR153	Q6NV75	609 aa		8.42	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	8.42	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		8.41	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	DAPK1	P53355	1430 aa		8.41	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA2	Q08379	1002 aa		8.41	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		8.41	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	8.41	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		8.4	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	8.4	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		8.39	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	PREX2	Q70Z35	1606 aa		8.39	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		8.39	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		8.38	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		8.38	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	MBD5	Q9P267	1494 aa		8.38	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		8.38	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		8.38	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		8.38	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		8.38	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		8.38	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		8.37	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	PYGB	P11216	843 aa		8.37	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		8.37	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		8.37	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCC1	P33527	1531 aa		8.36	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	GGT6	Q6P531	493 aa		8.36	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP10A	O60312	1499 aa		8.36	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	ROCK1	Q13464	1354 aa		8.35	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		8.35	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		8.35	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		8.35	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF3B	O15066	747 aa		8.35	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		8.35	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	8.35	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		8.35	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		8.35	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	PZP	P20742	1482 aa		8.34	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730		G3V3G9	751 aa		8.34	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		8.34	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	8.34	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	8.34	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	RICTOR	Q6R327	1708 aa		8.34	□□□□□ -1.07
C4BPB-208	ENST00000492730	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		8.34	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	ADGRL2	O95490	1459 aa		8.33	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		8.33	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	FBXO3	Q9UK99	471 aa		8.33	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		8.32	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		8.32	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	NCOA1	Q15788	1441 aa		8.32	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM52	Q96A61	297 aa		8.32	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		8.32	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	8.31	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	KDM5C	P41229	1560 aa		8.31	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		8.3	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		8.3	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		8.3	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	TONSL	Q96HA7	1378 aa		8.3	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		8.3	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	A2M	P01023	1474 aa		8.3	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP7A	Q04656	1500 aa		8.29	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	8.29	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		8.29	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		8.29	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		8.29	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		8.29	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	8.28	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	PBX2	P40425	430 aa		8.28	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		8.28	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	IFFO2	Q5TF58	517 aa		8.28	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	8.28	□□□□□ -1.08
C4BPB-208	ENST00000492730	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		8.27	□□□□□ -1.09
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF15	Q9NS87	1388 aa		8.27	□□□□□ -1.09
C4BPB-208	ENST00000492730	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		8.27	□□□□□ -1.09
C4BPB-208	ENST00000492730	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	8.26	□□□□□ -1.09
C4BPB-208	ENST00000492730	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		8.26	□□□□□ -1.09
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCA6	Q8N139	1617 aa		8.26	□□□□□ -1.09
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		8.26	□□□□□ -1.09
C4BPB-208	ENST00000492730	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	8.25	□□□□□ -1.09
C4BPB-208	ENST00000492730	ZMYM3	Q14202	1370 aa		8.24	□□□□□ -1.09
C4BPB-208	ENST00000492730	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		8.24	□□□□□ -1.09

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.5 ms