RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 PPLO60437 1756 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-204ENST00000476231 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-204ENST00000476231 IQGAP1P46940 1657 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-204ENST00000476231 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SYF2-204ENST00000476231 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.31■■□□□ 1.8
SYF2-204ENST00000476231 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SYF2-204ENST00000476231 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SYF2-204ENST00000476231 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.28■■□□□ 1.8
SYF2-204ENST00000476231 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SYF2-204ENST00000476231 ERVK-7P63135 1459 aa26.26■■□□□ 1.79
SYF2-204ENST00000476231 IDI1Q13907 227 aa26.24■■□□□ 1.79
SYF2-204ENST00000476231 TESK2Q96S53 571 aa26.24■■□□□ 1.79
SYF2-204ENST00000476231 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.23■■□□□ 1.79
SYF2-204ENST00000476231 PIK3C2GO75747 1445 aa26.21■■□□□ 1.79
SYF2-204ENST00000476231 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.2■■□□□ 1.79
SYF2-204ENST00000476231 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.2■■□□□ 1.79
SYF2-204ENST00000476231 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.2■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 MLECQ14165 292 aa26.2■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.2■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.19■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 TMF1P82094 1093 aa26.16■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 ZFYVE9O95405 1425 aa26.15■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.14■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.14■■□□□ 1.78
SYF2-204ENST00000476231 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
SYF2-204ENST00000476231 SLC24A1O60721 1099 aa26.1■■□□□ 1.77
SYF2-204ENST00000476231 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.1■■□□□ 1.77
SYF2-204ENST00000476231 ZMYM3Q14202 1370 aa26.1■■□□□ 1.77
SYF2-204ENST00000476231 ADGRB1O14514 1584 aa26.09■■□□□ 1.77
SYF2-204ENST00000476231 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.09■■□□□ 1.77
SYF2-204ENST00000476231 CDCA8Q53HL2 280 aa26.06■■□□□ 1.76
SYF2-204ENST00000476231 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.03■■□□□ 1.76
SYF2-204ENST00000476231 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.02■■□□□ 1.76
SYF2-204ENST00000476231 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.02■■□□□ 1.76
SYF2-204ENST00000476231 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
SYF2-204ENST00000476231 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SYF2-204ENST00000476231 NEFLP07196 543 aa25.98■■□□□ 1.75
SYF2-204ENST00000476231 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SYF2-204ENST00000476231 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SYF2-204ENST00000476231 TNRQ92752 1358 aa25.96■■□□□ 1.75
SYF2-204ENST00000476231 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.95■■□□□ 1.75
SYF2-204ENST00000476231 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.95■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 FKBP8Q14318 412 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 RALBP1Q15311 655 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.92■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 PANK3Q9H999 370 aa25.92■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 MRS2Q9HD23 443 aa25.92■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 CCDC184Q52MB2 194 aa25.91■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.91■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 MYOM1P52179 1685 aa25.91■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.89■■□□□ 1.74
SYF2-204ENST00000476231 ALKQ9UM73 1620 aa25.89■■□□□ 1.73
SYF2-204ENST00000476231 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
SYF2-204ENST00000476231 C3P01024 1663 aa25.86■■□□□ 1.73
SYF2-204ENST00000476231 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.85■■□□□ 1.73
SYF2-204ENST00000476231 NLRP1Q9C000 1473 aa25.85■■□□□ 1.73
SYF2-204ENST00000476231 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.85■■□□□ 1.73
SYF2-204ENST00000476231 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SYF2-204ENST00000476231 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SYF2-204ENST00000476231 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SYF2-204ENST00000476231 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.82■■□□□ 1.72
SYF2-204ENST00000476231 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SYF2-204ENST00000476231 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SYF2-204ENST00000476231 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SYF2-204ENST00000476231 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.79■■□□□ 1.72
SYF2-204ENST00000476231 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SYF2-204ENST00000476231 PTPRMP28827 1452 aa25.79■■□□□ 1.72
SYF2-204ENST00000476231 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.78■■□□□ 1.72
SYF2-204ENST00000476231 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.78■■□□□ 1.72
SYF2-204ENST00000476231 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.77■■□□□ 1.72
SYF2-204ENST00000476231 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SYF2-204ENST00000476231 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.77■■□□□ 1.72
SYF2-204ENST00000476231 STK26Q9P289 416 aa25.76■■□□□ 1.72
SYF2-204ENST00000476231 TMC1Q8TDI8 760 aa25.76■■□□□ 1.71
SYF2-204ENST00000476231 EVC2Q86UK5 1308 aa25.76■■□□□ 1.71
SYF2-204ENST00000476231 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SYF2-204ENST00000476231 DLC1Q96QB1 1528 aa25.75■■□□□ 1.71
SYF2-204ENST00000476231 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.75■■□□□ 1.71
SYF2-204ENST00000476231 NLRP13Q86W25 1043 aa25.75■■□□□ 1.71
SYF2-204ENST00000476231 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.74■■□□□ 1.71
SYF2-204ENST00000476231 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SYF2-204ENST00000476231 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SYF2-204ENST00000476231 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SYF2-204ENST00000476231 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.71■■□□□ 1.71
SYF2-204ENST00000476231 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SYF2-204ENST00000476231 PRAM1Q96QH2 718 aa25.69■■□□□ 1.7
SYF2-204ENST00000476231 POGKQ9P215 609 aa25.69■■□□□ 1.7
SYF2-204ENST00000476231 ABCC11Q96J66 1382 aa25.69■■□□□ 1.7
SYF2-204ENST00000476231 BCANQ96GW7 911 aa25.68■■□□□ 1.7
SYF2-204ENST00000476231 SLIT1O75093 1534 aa25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms