RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474293.2

SOGA3-206, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SOGA3, Length 772 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-206ENST00000474293 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SOGA3-206ENST00000474293 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.21■■□□□ 1.31
SOGA3-206ENST00000474293 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.2■■□□□ 1.3
SOGA3-206ENST00000474293 MSH5O43196 834 aa23.18■■□□□ 1.3
SOGA3-206ENST00000474293 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SOGA3-206ENST00000474293 RGS12O14924 1447 aa23.17■■□□□ 1.3
SOGA3-206ENST00000474293 KIF15Q9NS87 1388 aa23.16■■□□□ 1.3
SOGA3-206ENST00000474293 SHPRHQ149N8 1683 aa23.16■■□□□ 1.3
SOGA3-206ENST00000474293 ATF3P18847 181 aa23.16■■□□□ 1.3
SOGA3-206ENST00000474293 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SOGA3-206ENST00000474293 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.16■■□□□ 1.3
SOGA3-206ENST00000474293 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SOGA3-206ENST00000474293 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.15■■□□□ 1.3
SOGA3-206ENST00000474293 KANK1Q14678 1352 aa23.14■■□□□ 1.3
SOGA3-206ENST00000474293 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
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SOGA3-206ENST00000474293 C8orf37Q96NL8 207 aa23.13■■□□□ 1.29
SOGA3-206ENST00000474293 BRINP3Q76B58 766 aa23.12■■□□□ 1.29
SOGA3-206ENST00000474293 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.12■■□□□ 1.29
SOGA3-206ENST00000474293 ADGRB3O60242 1522 aa23.12■■□□□ 1.29
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SOGA3-206ENST00000474293 ERBINQ96RT1 1412 aa23.1■■□□□ 1.29
SOGA3-206ENST00000474293 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.1■■□□□ 1.29
SOGA3-206ENST00000474293 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.09■■□□□ 1.29
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SOGA3-206ENST00000474293 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
SOGA3-206ENST00000474293 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.07■■□□□ 1.28
SOGA3-206ENST00000474293 TBX22Q9Y458 520 aa23.07■■□□□ 1.28
SOGA3-206ENST00000474293 NOS1P29475 1434 aa23.07■■□□□ 1.28
SOGA3-206ENST00000474293 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.07■■□□□ 1.28
SOGA3-206ENST00000474293 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SOGA3-206ENST00000474293 ZFYVE9O95405 1425 aa23.05■■□□□ 1.28
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SOGA3-206ENST00000474293 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.05■■□□□ 1.28
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SOGA3-206ENST00000474293 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SOGA3-206ENST00000474293 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.02■■□□□ 1.28
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SOGA3-206ENST00000474293 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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SOGA3-206ENST00000474293 NGLY1Q96IV0 654 aa23.01■■□□□ 1.27
SOGA3-206ENST00000474293 SETD5Q9C0A6 1442 aa23■■□□□ 1.27
SOGA3-206ENST00000474293 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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SOGA3-206ENST00000474293 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.98■■□□□ 1.27
SOGA3-206ENST00000474293 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.97■■□□□ 1.27
SOGA3-206ENST00000474293 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.97■■□□□ 1.27
SOGA3-206ENST00000474293 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.95■■□□□ 1.26
SOGA3-206ENST00000474293 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SOGA3-206ENST00000474293 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
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SOGA3-206ENST00000474293 PTPRUQ92729 1446 aa22.91■■□□□ 1.26
SOGA3-206ENST00000474293 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.91■■□□□ 1.26
SOGA3-206ENST00000474293 DAPK1P53355 1430 aa22.91■■□□□ 1.26
SOGA3-206ENST00000474293 MST1RQ04912 1400 aa22.91■■□□□ 1.26
SOGA3-206ENST00000474293 PIK3R4Q99570 1358 aa22.89■■□□□ 1.26
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SOGA3-206ENST00000474293 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.89■■□□□ 1.25
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SOGA3-206ENST00000474293 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.88■■□□□ 1.25
SOGA3-206ENST00000474293 DCCP43146 1447 aa22.87■■□□□ 1.25
SOGA3-206ENST00000474293 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.86■■□□□ 1.25
SOGA3-206ENST00000474293 CCDC125Q86Z20 511 aa22.84■■□□□ 1.25
SOGA3-206ENST00000474293 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SOGA3-206ENST00000474293 TRPM2O94759 1503 aa22.83■■□□□ 1.25
SOGA3-206ENST00000474293 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.82■■□□□ 1.24
SOGA3-206ENST00000474293 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SOGA3-206ENST00000474293 ATRNO75882 1429 aa22.79■■□□□ 1.24
SOGA3-206ENST00000474293 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.79■■□□□ 1.24
SOGA3-206ENST00000474293 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.76■■□□□ 1.23
SOGA3-206ENST00000474293 ADRA2BP18089 450 aa22.75■■□□□ 1.23
SOGA3-206ENST00000474293 UNC13BO14795 1591 aa22.72■■□□□ 1.23
SOGA3-206ENST00000474293 ORAI2Q96SN7 254 aa22.72■■□□□ 1.23
SOGA3-206ENST00000474293 METP08581 1390 aa22.72■■□□□ 1.23
SOGA3-206ENST00000474293 PTCH1Q13635 1447 aa22.72■■□□□ 1.23
SOGA3-206ENST00000474293 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.72■■□□□ 1.23
SOGA3-206ENST00000474293 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SOGA3-206ENST00000474293 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
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SOGA3-206ENST00000474293 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.7■■□□□ 1.22
SOGA3-206ENST00000474293 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.7■■□□□ 1.22
SOGA3-206ENST00000474293 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.68■■□□□ 1.22
SOGA3-206ENST00000474293 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SOGA3-206ENST00000474293 EP400Q96L91 3159 aa22.67■■□□□ 1.22
SOGA3-206ENST00000474293 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SOGA3-206ENST00000474293 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.65■■□□□ 1.22
SOGA3-206ENST00000474293 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SOGA3-206ENST00000474293 ADGRL2O95490 1459 aa22.64■■□□□ 1.21
SOGA3-206ENST00000474293 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.63■■□□□ 1.21
SOGA3-206ENST00000474293 LRP5O75197 1615 aa22.62■■□□□ 1.21
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SOGA3-206ENST00000474293 E9PCH4 1651 aa22.61■■□□□ 1.21
SOGA3-206ENST00000474293 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SOGA3-206ENST00000474293 MYOM2P54296 1465 aa22.59■■□□□ 1.21
SOGA3-206ENST00000474293 LAMC1P11047 1609 aa22.58■■□□□ 1.21
SOGA3-206ENST00000474293 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
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