RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 PTPREP23469 700 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 EYA1Q99502 592 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 ARID3CA6NKF2 412 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 NBPF26B4DH59 902 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 APBB1O00213 710 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 TRAK2O60296 914 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 SULF1Q8IWU6 871 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 TSKSQ9UJT2 592 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 CD46P15529 392 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 DNAJB2P25686 324 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 PBX2P40425 430 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 BANK1Q8NDB2 785 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 ARID3AQ99856 593 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-207ENST00000470201 RFC5P40937 340 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 RAD21O60216 631 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 TATDN2Q93075 761 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 PNMA3Q9UL41 463 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 PACS2Q86VP3 889 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 SPTLC1O15269 473 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 C3orf80F5H4A9 247 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 GJA5P36382 358 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 POM121Q96HA1 1249 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNH8Q96L42 1107 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 COG6Q9Y2V7 657 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-207ENST00000470201 SOCS7O14512 581 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGAP33O14559 1287 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 PROX2Q3B8N5 592 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNK17Q96T54 332 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 SNRKQ9NRH2 765 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 RDH13Q8NBN7 331 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 SMAPO00193 183 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 LILRB3O75022 631 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 KDM4AO75164 1064 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 USP46P62068 366 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 NDUFV2P19404 249 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 PSEN2P49810 448 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 QPCTQ16769 361 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-207ENST00000470201 HOXA2O43364 376 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 GCGRP47871 477 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 WWC1Q8IX03 1113 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 TK2O00142 265 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 AP1G2O75843 785 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 USP17L8P0C7I0 530 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 FDX1P10109 184 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC10A3P09131 477 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 HRCP23327 699 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC4A3P48751 1232 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-207ENST00000470201 HRO43593 1189 aa8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms