RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 GSK3AP49840 483 aa7.7□□□□□ -1.18
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SHQ1-204ENST00000468347 S1PR4O95977 384 aa7.69□□□□□ -1.18
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SHQ1-204ENST00000468347 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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SHQ1-204ENST00000468347 Q8N3U1 123 aa7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-204ENST00000468347 IRS1P35568 1242 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-204ENST00000468347 BTBD11A6QL63 1104 aa7.25□□□□□ -1.25
SHQ1-204ENST00000468347 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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