RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468284.1

CKAP2-205, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene CKAP2, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-205ENST00000468284 FBXW7Q969H0 707 aa16.23■□□□□ 0.19
CKAP2-205ENST00000468284 PTPRGP23470 1445 aa16.21■□□□□ 0.19
CKAP2-205ENST00000468284 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa16.21■□□□□ 0.19
CKAP2-205ENST00000468284 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.2■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 ABCC2Q92887 1545 aa16.19■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 CUL7Q14999 1698 aa16.18■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 NBPF3Q9H094 633 aa16.18■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.17■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 GOLGA8CPA6NN73 597 aa16.17■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 CFAP44Q96MT7 982 aa16.17■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.16■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 PTPN5P54829 565 aa16.16■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 EPAS1Q99814 870 aa16.16■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 COL9A1P20849 921 aa16.15■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
CKAP2-205ENST00000468284 PROX2Q3B8N5 592 aa16.13■□□□□ 0.17
CKAP2-205ENST00000468284 WNT2BQ93097 391 aa16.13■□□□□ 0.17
CKAP2-205ENST00000468284 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.12■□□□□ 0.17
CKAP2-205ENST00000468284 THSD4Q6ZMP0 1018 aa16.12■□□□□ 0.17
CKAP2-205ENST00000468284 DDX12PQ92771 950 aa16.11■□□□□ 0.17
CKAP2-205ENST00000468284 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.11■□□□□ 0.17
CKAP2-205ENST00000468284 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.11■□□□□ 0.17
CKAP2-205ENST00000468284 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa16.09■□□□□ 0.17
CKAP2-205ENST00000468284 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.09■□□□□ 0.17
CKAP2-205ENST00000468284 PDIA6Q15084 440 aa16.08■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 IGF1RP08069 1367 aa16.08■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 ILDR2Q71H61 639 aa16.07■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.07■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 KIF21BO75037 1637 aa16.06■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 UACAQ9BZF9 1416 aa16.06■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 E2F4Q16254 413 aa16.04■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 WDR70Q9NW82 654 aa16.04■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.03■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.02■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 NBR1Q14596 966 aa16.02■□□□□ 0.16
CKAP2-205ENST00000468284 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CKAP2-205ENST00000468284 KIAA1468Q9P260 1216 aa16.01■□□□□ 0.15
CKAP2-205ENST00000468284 ANKK1Q8NFD2 765 aa16■□□□□ 0.15
CKAP2-205ENST00000468284 DISP1Q96F81 1524 aa15.99■□□□□ 0.15
CKAP2-205ENST00000468284 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CKAP2-205ENST00000468284 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CKAP2-205ENST00000468284 LAPTM4BQ86VI4 370 aa15.99■□□□□ 0.15
CKAP2-205ENST00000468284 PTPRMP28827 1452 aa15.98■□□□□ 0.15
CKAP2-205ENST00000468284 MAP3K7O43318 606 aa15.97■□□□□ 0.15
CKAP2-205ENST00000468284 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa15.96■□□□□ 0.15
CKAP2-205ENST00000468284 SOCS7O14512 581 aa15.96■□□□□ 0.15
CKAP2-205ENST00000468284 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 IQGAP2Q13576 1575 aa15.95■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 CD109Q6YHK3 1445 aa15.94■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.94■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.93■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.93■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 KIF27Q86VH2 1401 aa15.93■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.92■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.92■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 BCAMP50895 628 aa15.91■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 HSPA2P54652 639 aa15.9■□□□□ 0.14
CKAP2-205ENST00000468284 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.89■□□□□ 0.13
CKAP2-205ENST00000468284 GRXCR2A6NFK2 248 aa15.89■□□□□ 0.13
CKAP2-205ENST00000468284 IFFO2Q5TF58 517 aa15.88■□□□□ 0.13
CKAP2-205ENST00000468284 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.88■□□□□ 0.13
CKAP2-205ENST00000468284 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CKAP2-205ENST00000468284 CERKQ8TCT0 537 aa15.87■□□□□ 0.13
CKAP2-205ENST00000468284 TSKSQ9UJT2 592 aa15.85■□□□□ 0.13
CKAP2-205ENST00000468284 MADDQ8WXG6 1647 aa15.85■□□□□ 0.13
CKAP2-205ENST00000468284 KIAA0556O60303 1618 aa15.84■□□□□ 0.13
CKAP2-205ENST00000468284 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CKAP2-205ENST00000468284 PACS2Q86VP3 889 aa15.84■□□□□ 0.13
CKAP2-205ENST00000468284 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.83■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 RAPGEF3O95398 923 aa15.82■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.82■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.82■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.8■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.79■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 WBP1LQ9NX94 342 aa15.79■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 OSBPP22059 807 aa15.78■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 PRSS12P56730 875 aa15.78■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 LRCH3Q96II8 777 aa15.78■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 A0A0G2JS52 829 aa15.77■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.77■□□□□ 0.12
CKAP2-205ENST00000468284 ARID3CA6NKF2 412 aa15.76■□□□□ 0.11
CKAP2-205ENST00000468284 ABCA8O94911 1581 aa15.75■□□□□ 0.11
CKAP2-205ENST00000468284 CDHR5Q9HBB8 845 aa15.75■□□□□ 0.11
CKAP2-205ENST00000468284 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CKAP2-205ENST00000468284 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.74■□□□□ 0.11
CKAP2-205ENST00000468284 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CKAP2-205ENST00000468284 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.74■□□□□ 0.11
CKAP2-205ENST00000468284 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.7 ms