RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464495.4

SOGA3-204, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SOGA3, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-204ENST00000464495 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
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SOGA3-204ENST00000464495 TSPY10P0CW01 314 aa15.73■□□□□ 0.11
SOGA3-204ENST00000464495 EID1Q9Y6B2 187 aa15.73■□□□□ 0.11
SOGA3-204ENST00000464495 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.73■□□□□ 0.11
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SOGA3-204ENST00000464495 UBR1Q8IWV7 1749 aa15.7■□□□□ 0.1
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SOGA3-204ENST00000464495 JCADQ9P266 1359 aa15.62■□□□□ 0.09
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SOGA3-204ENST00000464495 C14orf37Q86TY3 774 aa15.48■□□□□ 0.07
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SOGA3-204ENST00000464495 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.45■□□□□ 0.06
SOGA3-204ENST00000464495 IDI1Q13907 227 aa15.45■□□□□ 0.06
SOGA3-204ENST00000464495 KIF15Q9NS87 1388 aa15.45■□□□□ 0.06
SOGA3-204ENST00000464495 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.44■□□□□ 0.06
SOGA3-204ENST00000464495 ADGRB3O60242 1522 aa15.43■□□□□ 0.06
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SOGA3-204ENST00000464495 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
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SOGA3-204ENST00000464495 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.37■□□□□ 0.05
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SOGA3-204ENST00000464495 TBX22Q9Y458 520 aa15.36■□□□□ 0.05
SOGA3-204ENST00000464495 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SOGA3-204ENST00000464495 NOS1P29475 1434 aa15.35■□□□□ 0.05
SOGA3-204ENST00000464495 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
SOGA3-204ENST00000464495 NGLY1Q96IV0 654 aa15.35■□□□□ 0.05
SOGA3-204ENST00000464495 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SOGA3-204ENST00000464495 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.33■□□□□ 0.04
SOGA3-204ENST00000464495 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.33■□□□□ 0.04
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