RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 TTC13Q8NBP0 860 aa5.95□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 MTRQ99707 1265 aa5.94□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 IL21Q9HBE4 155 aa5.94□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 APLP1P51693 650 aa5.93□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 PTGDRQ13258 359 aa5.93□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 TJAP1Q5JTD0 557 aa5.93□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 EYA1Q99502 592 aa5.92□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 ZMYND15Q9H091 742 aa5.92□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 RSPH6AQ9H0K4 717 aa5.92□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 SEMA3EO15041 775 aa5.91□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 DNAJB2P25686 324 aa5.91□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 SMYD5Q6GMV2 418 aa5.91□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 PRR14Q9BWN1 585 aa5.91□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC24A3Q9HC58 644 aa5.91□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 FCHSD2O94868 740 aa5.9□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 COPS2P61201 443 aa5.9□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ANKRD28-205ENST00000460278 UBTFP17480 764 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF516Q92618 1163 aa5.89□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 GGCXP38435 758 aa5.88□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 PPP1R18Q6NYC8 613 aa5.88□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa5.88□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 ADGRG1Q9Y653 693 aa5.88□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 RCCD1A6NED2 376 aa5.87□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM161AQ3B820 660 aa5.87□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 Q6ZNB5 142 aa5.87□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 PRKD2Q9BZL6 878 aa5.87□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM134Q9H6X4 195 aa5.87□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 ZMYND10O75800 440 aa5.86□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 KMT5BQ4FZB7 885 aa5.86□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 ZPR1O75312 459 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 OATP04181 439 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 HIC1Q14526 733 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 LAPTM4AQ15012 233 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 NKX2-3Q8TAU0 364 aa5.85□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 GFRA3O60609 400 aa5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 CFHP08603 1231 aa5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-205ENST00000460278 RSPH4AQ5TD94 716 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 BARGINQ6ZT62 677 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 AK7Q96M32 723 aa5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 V9GY48 417 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 TMUB1Q9BVT8 246 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 ZBTB7CA1YPR0 619 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 GNPATO15228 680 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 MYT1Q01538 1121 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 TLL1O43897 1013 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC10A3P09131 477 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 NR1I2O75469 434 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 HRCP23327 699 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 FECHP22830 423 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 GPIHBP1Q8IV16 184 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 RDH13Q8NBN7 331 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-205ENST00000460278 RNF223E7ERA6 249 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 IL27Q8NEV9 243 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 DDX11L8A8MPP1 907 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 S1PR4O95977 384 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 ADH1BP00325 375 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC19A1P41440 591 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 FLIIQ13045 1269 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 TRAF7Q6Q0C0 670 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 ANKLE1Q8NAG6 615 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 ARID3AQ99856 593 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 KDM4CQ9H3R0 1056 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR37O15354 613 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 SCUBE3Q8IX30 993 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC6A16Q9GZN6 736 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 SULF1Q8IWU6 871 aa5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 NLRP7Q8WX94 980 aa5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 SPSB2Q99619 263 aa5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 FUT2Q10981 343 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 SPRYD7Q5W111 196 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-205ENST00000460278 APBB1O00213 710 aa5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-205ENST00000460278 ATP6V1AP38606 617 aa5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-205ENST00000460278 GCGRP47871 477 aa5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-205ENST00000460278 PDE4DQ08499 809 aa5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF697Q5TEC3 545 aa5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-205ENST00000460278 TRIM66O15016 1216 aa5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-205ENST00000460278 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-205ENST00000460278 GRIPAP1Q4V328 841 aa5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-205ENST00000460278 MORN1Q5T089 497 aa5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms