RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456256.6

PLCB2-202, Transcript of phospholipase C beta 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PLCB2, Length 4,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2-202ENST00000456256 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PLCB2-202ENST00000456256 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 RUNDC1Q96C34 613 aa22.3■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 PRAM1Q96QH2 718 aa22.3■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.29■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 COG3Q96JB2 828 aa22.29■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.29■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.28■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.28■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 AMPHP49418 695 aa22.27■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 RIPK4P57078 832 aa22.27■■□□□ 1.16
PLCB2-202ENST00000456256 HMOX1P09601 288 aa22.26■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 ADGRL1O94910 1474 aa22.25■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 SLC4A3P48751 1232 aa22.25■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 PANK1Q8TE04 598 aa22.24■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 CD109Q6YHK3 1445 aa22.24■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 SAMD9Q5K651 1589 aa22.23■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.23■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 CASC1Q6TDU7 716 aa22.22■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.21■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.2■■□□□ 1.15
PLCB2-202ENST00000456256 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 NGEFQ8N5V2 710 aa22.2■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.2■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 NUP160Q12769 1436 aa22.19■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 FANCAO15360 1455 aa22.19■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.19■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 BCAR3O75815 825 aa22.19■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.19■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.18■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 PBRM1Q86U86 1689 aa22.18■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 CABP1Q9NZU7 370 aa22.17■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.17■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 FAM161AQ3B820 660 aa22.16■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 PLCH2O75038 1416 aa22.16■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.16■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.15■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 IDI1Q13907 227 aa22.15■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 HSCBQ8IWL3 235 aa22.15■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 PZPP20742 1482 aa22.15■■□□□ 1.14
PLCB2-202ENST00000456256 STK31Q9BXU1 1019 aa22.14■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 CDK19Q9BWU1 502 aa22.13■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.12■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.11■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.09■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.09■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.08■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 PRKAR2BP31323 418 aa22.08■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.08■■□□□ 1.13
PLCB2-202ENST00000456256 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.07■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.07■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.07■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.06■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.06■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 SKAP1Q86WV1 359 aa22.06■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 TESK2Q96S53 571 aa22.06■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.05■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 NOS1P29475 1434 aa22.05■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 CEP170Q5SW79 1584 aa22.05■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.04■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 NECTIN2Q92692 538 aa22.04■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.04■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 ASXL2Q76L83 1435 aa22.03■■□□□ 1.12
PLCB2-202ENST00000456256 SLFN5Q08AF3 891 aa22.01■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 WWC1Q8IX03 1113 aa22.01■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.01■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 KCNJ4P48050 445 aa22■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.99■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 NLRP6P59044 892 aa21.98■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 LNPKQ9C0E8 428 aa21.98■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.98■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.98■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 GNAI1P63096 354 aa21.98■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 KDM6BO15054 1643 aa21.98■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 HMMRO75330 724 aa21.96■■□□□ 1.11
PLCB2-202ENST00000456256 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms