RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC27Q2M243 656 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 SPTLC1O15269 473 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 RFX1P22670 979 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 CERKQ8TCT0 537 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.54□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 POTEGQ6S5H5 508 aa7.53□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 PADI6Q6TGC4 694 aa7.53□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.53□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 AP1G2O75843 785 aa7.52□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.52□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 IER5LQ5T953 404 aa7.52□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.52□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 WASHC4Q2M389 1173 aa7.51□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.51□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.51□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.51□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC34A2O95436 690 aa7.5□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 GJA5P36382 358 aa7.5□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 LILRB3O75022 631 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L8P0C7I0 530 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 PLCG2P16885 1265 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 TTC13Q8NBP0 860 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.49□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 POTEFA5A3E0 1075 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 QPCTQ16769 361 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.48□□□□□ -1.21
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
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CBX1P4-201ENST00000439415 MOXD2PA6NHM9 499 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 SULF1Q8IWU6 871 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 JPH4Q96JJ6 628 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 ATG7O95352 703 aa7.44□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.43□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFV2P19404 249 aa7.43□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 PRSS12P56730 875 aa7.43□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.43□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 RCCD1A6NED2 376 aa7.42□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.42□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 ALG2Q9H553 416 aa7.42□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 USP35Q9P2H5 1018 aa7.42□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 VAC14Q08AM6 782 aa7.41□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.41□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 SOX11P35716 441 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 FOSBP53539 338 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR37L1O60883 481 aa7.39□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.39□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.39□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 CDCA8Q53HL2 280 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 UCN2Q96RP3 112 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 EYA1Q99502 592 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 UNCXA6NJT0 531 aa7.37□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.37□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 KDM4AO75164 1064 aa7.36□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 SEC24BO95487 1268 aa7.36□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJB2P25686 324 aa7.36□□□□□ -1.23
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