RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.26■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 NGEFQ8N5V2 710 aa22.25■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.25■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.25■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 PANK3Q9H999 370 aa22.25■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.24■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 USP35Q9P2H5 1018 aa22.24■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.22■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 BACH2Q9BYV9 841 aa22.22■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 MYOM1P52179 1685 aa22.21■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 MYOM2P54296 1465 aa22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 RGL3Q3MIN7 710 aa22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 PDE4AP27815 886 aa22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 CLTCL1P53675 1640 aa22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 DIP2BQ9P265 1576 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF521Q96K83 1311 aa22.15■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 KANK1Q14678 1352 aa22.14■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 GLI2P10070 1586 aa22.14■■□□□ 1.14
HCLS1-202ENST00000428394 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 PPP2R1AP30153 589 aa22.12■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.12■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.12■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.12■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 IFT172Q9UG01 1749 aa22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 ATP7AQ04656 1500 aa22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.09■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 KIF1BO60333 1816 aa22.08■■□□□ 1.13
HCLS1-202ENST00000428394 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-202ENST00000428394 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-202ENST00000428394 GOLGA2Q08379 1002 aa22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-202ENST00000428394 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-202ENST00000428394 CRBNQ96SW2 442 aa22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-202ENST00000428394 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-202ENST00000428394 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.06■■□□□ 1.12
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HCLS1-202ENST00000428394 ABCA6Q8N139 1617 aa22.03■■□□□ 1.12
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.03■■□□□ 1.12
HCLS1-202ENST00000428394 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.03■■□□□ 1.12
HCLS1-202ENST00000428394 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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HCLS1-202ENST00000428394 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.02■■□□□ 1.12
HCLS1-202ENST00000428394 NBR1Q14596 966 aa22.01■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 SLFN5Q08AF3 891 aa22■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 AAMPQ13685 434 aa22■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 FANCAO15360 1455 aa22■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 ERVK-7P63135 1459 aa21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 CD109Q6YHK3 1445 aa21.98■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 ZMYM3Q14202 1370 aa21.96■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 E9PSI1 815 aa21.96■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 FAM161AQ3B820 660 aa21.95■■□□□ 1.11
HCLS1-202ENST00000428394 ADGRB3O60242 1522 aa21.95■■□□□ 1.1
HCLS1-202ENST00000428394 PLIN1O60240 522 aa21.93■■□□□ 1.1
HCLS1-202ENST00000428394 TSPOAP1O95153 1857 aa21.91■■□□□ 1.1
HCLS1-202ENST00000428394 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.91■■□□□ 1.1
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HCLS1-202ENST00000428394 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.91■■□□□ 1.1
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HCLS1-202ENST00000428394 ADGRL1O94910 1474 aa21.9■■□□□ 1.1
HCLS1-202ENST00000428394 NEO1Q92859 1461 aa21.89■■□□□ 1.09
HCLS1-202ENST00000428394 PPLO60437 1756 aa21.88■■□□□ 1.09
HCLS1-202ENST00000428394 MROH2AA6NES4 1674 aa21.88■■□□□ 1.09
HCLS1-202ENST00000428394 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.86■■□□□ 1.09
HCLS1-202ENST00000428394 NEFMP07197 916 aa21.86■■□□□ 1.09
HCLS1-202ENST00000428394 SHPRHQ149N8 1683 aa21.86■■□□□ 1.09
HCLS1-202ENST00000428394 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.85■■□□□ 1.09
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.85■■□□□ 1.09
HCLS1-202ENST00000428394 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.84■■□□□ 1.09
HCLS1-202ENST00000428394 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.83■■□□□ 1.09
HCLS1-202ENST00000428394 AFAP1Q8N556 730 aa21.83■■□□□ 1.09
HCLS1-202ENST00000428394 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
HCLS1-202ENST00000428394 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.83■■□□□ 1.09
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